More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0717 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003761  iron-containing alcohol dehydrogenase  75 
 
 		 414 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0152546  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02634  alcohol dehydrogenase  75.7 
 
 		 414 aa  635    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0717  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 422 aa  866    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.21 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0253  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.64 
 
 		 384 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0534  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.59 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.0000192772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1004  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.64 
 
 		 383 aa  222  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24600  predicted protein  35.94 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.366572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0492  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.77 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.05 
 
 		 395 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1426  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 		 396 aa  209  7e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2617  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1246  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.99 
 
 		 393 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.404887  normal  0.363683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0211  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.03 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1049  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.76 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1485  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.59 
 
 		 407 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.593755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4097  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.91 
 
 		 387 aa  197  3e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.244199  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1319  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.83 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1199  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 380 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0888  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.21 
 
 		 402 aa  192  8e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.867893  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1273  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.56 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2661  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2802  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1767  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000492004  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0080  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.99 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0441  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.67 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.49 
 
 		 400 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.49 
 
 		 400 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 		 392 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.18 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.22 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.95 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.74 
 
 		 382 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3121  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.83 
 
 		 400 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481233 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.38 
 
 		 382 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2204  alcohol dehydrogenase, iron-containing  30.03 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0140  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.15 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1477  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.14 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.743318  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3987  Iron-containing alcohol dehydrogenase  32.48 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4285  alcohol dehydrogenase II  31.97 
 
 		 382 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1421  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0990  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.85 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.71484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2047  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0159898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1071  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 358 aa  146  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0627  bifunctional acetaldehyde-CoA/alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 		 872 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2579  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.59 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 		 384 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.76 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.91 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00437  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.86 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000107236  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.89 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.1 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1311  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.51 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.82 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.66 
 
 		 382 aa  139  8.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  33.11 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3658  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 383 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.45 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.12 
 
 		 376 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.64 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07980  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.13 
 
 		 382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.421647  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2204  hypothetical protein  32.78 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.61 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2682  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3080  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 		 387 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.53 
 
 		 405 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3121  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.99 
 
 		 387 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00478821  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0930  Iron-containing alcohol dehydrogenase  31.52 
 
 		 383 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.13 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  28.31 
 
 		 383 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.75 
 
 		 387 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2478  iron-containing alcohol dehydrogenase  33 
 
 		 395 aa  136  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03444  predicted Fe-containing alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0119  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3917  putative alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.35 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3794  putative alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0913  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.93 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2939  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.93 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.284503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2943  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.93 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0124  putative alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4960  putative alcohol dehydrogenase  31.07 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4087  putative alcohol dehydrogenase  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  29.94 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03395  hypothetical protein  31.15 
 
 		 383 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02644  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.93 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4063  L-1,2-propanediol oxidoreductase  30.93 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1756  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 377 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0953887  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02606  hypothetical protein  30.93 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1180  1,3-propanediol dehydrogenase  34.78 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.440796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1011  1,3-propanediol dehydrogenase  34.78 
 
 		 385 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000128902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>