More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0052 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  100 
 
 		 89 bp  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16310  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.352958  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  90.14 
 
 		 88 bp  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  97.56 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0017  tRNA-Leu  89.04 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0015  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0009  tRNA-Leu  85.39 
 
 		 89 bp  73.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0045  tRNA-Leu  93.62 
 
 		 87 bp  69.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 85 bp  69.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0057  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 90 bp  69.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000872679  normal  0.444657 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0005  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 87 bp  67.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.886135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0086  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0030  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0290157  normal  0.678466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0020  tRNA-Leu  87.67 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0381951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0072  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0063  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 89 bp  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.727445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0048  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 83 bp  63.9  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  88.89 
 
 		 86 bp  63.9  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0027  tRNA-Leu  95 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.787126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0074  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0025  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.316898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0058  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0055  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.924042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 89 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0045  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.102095 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0066  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.421355 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0031  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00794076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0033  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000241168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0032  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0051  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 84 bp  60  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0070  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0006  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000413572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0026  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00329777  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0020  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.424906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0069  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.365522  normal  0.0296897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  87.14 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6050  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.981043  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0063  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.294386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0002  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 83 bp  58  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.1151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  95 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0037  tRNA-Leu  92.5 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507669  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  95 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0059  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.310477  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0073  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0032  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000644155  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0049  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0102657  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0050  tRNA-Leu  92.31 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0025278  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0019  tRNA-Leu  100 
 
 		 90 bp  54  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.123367  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0026  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243318 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1890  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00084  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0537561  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0079  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0203589  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0080  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.02179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3446  tRNA-Leu  90.48 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4961  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000179002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0028  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4159  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000704733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4917  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000963852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0122  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000057209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4916  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000645766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4321  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000341532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0062  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0057  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0404485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4876  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000008654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4963  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000169309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0029  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.322054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4808  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000052486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0057  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000529794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4962  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000175711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0096  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0439108  hitchhiker  0.000125636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0036  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4915  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000252066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4163  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000000225021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4875  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000898834  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4874  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000096251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>