91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1505 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1505  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  100 
 
 		 396 aa  769    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00635225  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1685  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  28.04 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.427643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0468  cytochrome oxidase,subunit I  32.54 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.117972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1353  cytochrome oxidase,subunit I  34.67 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0321  cytochrome oxidase,subunit I  33.47 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.129729 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7914  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  28.16 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3723  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.15 
 
 		 458 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1110  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.77 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.22 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.22 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  27.98 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.23 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5647  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.67 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.41115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.7 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.7 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2243  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.94 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0392435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2518  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.11 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.500604  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4271  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.14 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4159  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.14 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.719863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0740  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  24.74 
 
 		 468 aa  53.9  0.000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1393  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25 
 
 		 442 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5460  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5073  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4740  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.98 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5313  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13345e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4917  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5395  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5338  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  24.75 
 
 		 451 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4905  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2688  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.49 
 
 		 449 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.367978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0736  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.49 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0108814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2910  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.7 
 
 		 448 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0579  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25 
 
 		 449 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5615  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000237735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5344  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.25 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0552  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.23 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.343983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2612  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.13 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5015  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.75 
 
 		 451 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0119  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.94 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2095  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  20.1 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5724  hypothetical protein  23.94 
 
 		 462 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4604  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  29.33 
 
 		 443 aa  47.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0125829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2016  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.53 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3602  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.84 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1142  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.72 
 
 		 518 aa  47.4  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6443  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.4 
 
 		 466 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.470691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3840  putative cytochrome oxidase subunit I  25 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.354412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6968  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.15 
 
 		 466 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1302  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  27.48 
 
 		 518 aa  47  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000643415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5232  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  21.88 
 
 		 453 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.534541 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2203  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.53 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000111713 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5400  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.51 
 
 		 466 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165282  normal  0.0810428 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5685  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 466 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.962592  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_003296  RS03186  putative transmembrane cytochrome bd-II oxidase (subunit I) oxidoreductase protein  23.3 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.20139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1422  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6407  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.98 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3760  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.51 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1318  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.48 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0277706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1565  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.48 
 
 		 518 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3118  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  27.56 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.358034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1112  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.15 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6552  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  26.02 
 
 		 466 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.69 
 
 		 535 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.6 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0304  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.32 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1310  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  22.55 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000127707  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.6 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0256  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.31 
 
 		 555 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3091  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  22.12 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000134482  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0467  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.52 
 
 		 514 aa  45.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.455582  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6192  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.91 
 
 		 462 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1167  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  22.83 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000118063  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2349  cytochrome bd-I oxidase subunit I  26.72 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00263445  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  24.02 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3280  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  26.83 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2688  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  22.18 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0249782  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3286  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  25.95 
 
 		 518 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1274  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.49 
 
 		 521 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  23.88 
 
 		 470 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 470 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.1 
 
 		 470 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  24.1 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7066  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.64 
 
 		 466 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  24.1 
 
 		 473 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2196  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.56 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2993  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.95 
 
 		 518 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.335828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0638  putative cytochrome oxidase subunit I  24.43 
 
 		 483 aa  42.7  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2979  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.95 
 
 		 518 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000559301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1384  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.95 
 
 		 518 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3137  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  25.95 
 
 		 518 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0660944  normal  0.733432 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3014  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  23.11 
 
 		 447 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>