More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6443 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0836  ubiquinol oxidase family protein  74.65 
 
 
592 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0222344  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6443  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  100 
 
 
466 aa  941    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.470691 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4853  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  74.11 
 
 
470 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  0.189641 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5400  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  95.06 
 
 
466 aa  818    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165282  normal  0.0810428 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1835  ubiquinol oxidase family protein  74.65 
 
 
470 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00477233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5120  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  74.83 
 
 
465 aa  685    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.204733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1770  ubiquinol oxidase family protein  74.65 
 
 
617 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.257846  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6552  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  97 
 
 
466 aa  877    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5987 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6968  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  97.64 
 
 
466 aa  881    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0428  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  74.65 
 
 
470 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0175  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  75.06 
 
 
470 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.770178  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4791  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  75.52 
 
 
470 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2148  ubiquinol oxidase family protein  73.96 
 
 
553 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6192  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  84.33 
 
 
462 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7066  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  97 
 
 
466 aa  854    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.319737  normal  0.558791 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5365  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  73.05 
 
 
473 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0119  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  85.34 
 
 
462 aa  812    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3840  putative cytochrome oxidase subunit I  85.19 
 
 
462 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.354412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1810  putative cytochrome oxidase subunit I  76.21 
 
 
471 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0784206 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5724  hypothetical protein  83.48 
 
 
462 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.20304  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1422  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  97.21 
 
 
491 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5383  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  75.35 
 
 
559 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.330151  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2100  ubiquinol oxidase family protein  74.65 
 
 
470 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4818  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  73.05 
 
 
473 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5685  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  97.64 
 
 
466 aa  840    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.962592  normal  0.220109 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3307  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  71.18 
 
 
535 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.145074 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0335  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  74.65 
 
 
470 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148907  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1127  ubiquinol oxidase family protein  74.65 
 
 
470 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5478  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  75.52 
 
 
470 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0727881  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6407  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  97.21 
 
 
491 aa  857    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3386  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.1 
 
 
471 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2529  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.81 
 
 
471 aa  587  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.895258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3130  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  65.59 
 
 
467 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.176017 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0394  cyanide-insensitive oxidase CioA  61.51 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4284  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  61.29 
 
 
480 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3118  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit I  60.77 
 
 
480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0412  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  61.51 
 
 
467 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  hitchhiker  0.0000241042 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0400  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  61.51 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.603816  hitchhiker  5.12206e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0454  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  61.51 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.84306  hitchhiker  0.00000000000000419123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0391  cytochrome bd-II oxidase subunit 1  61.51 
 
 
467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  3.45959e-19 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2859  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  64.91 
 
 
466 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.664602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4651  ubiquinol oxidase subunit I, cyanide insensitive  61.61 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4513  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  61.61 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.307129  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4645  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  61.39 
 
 
478 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.666381  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0943  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  59.66 
 
 
476 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1087  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  59.66 
 
 
476 aa  569  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1177  cyanide insensitive terminal oxidase  62.95 
 
 
482 aa  570  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13030  CioA, cyanide insensitive terminal oxidase  62.73 
 
 
488 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4101  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  62.03 
 
 
483 aa  565  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.142601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2131  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  63.42 
 
 
468 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.566764  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000387  putative Cytochrome bd2 subunit I  62.25 
 
 
457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0746  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  60.17 
 
 
479 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265352  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2644  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.29 
 
 
474 aa  559  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0787  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.52 
 
 
478 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4893  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.75 
 
 
478 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.455192  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3153  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  61.7 
 
 
466 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4282  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  61.2 
 
 
479 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.586205  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1472  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  65.22 
 
 
466 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.412208 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4955  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  63.6 
 
 
477 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11050  Cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  60.3 
 
 
476 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3272  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  60.35 
 
 
473 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.967783  normal  0.83445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4648  cyanide-insensitive terminal oxidase CioA  59.61 
 
 
479 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3573  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.83 
 
 
444 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0930  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.06 
 
 
444 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0914  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.6 
 
 
444 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0964  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.75 
 
 
446 aa  525  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.694189  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3376  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  58.06 
 
 
444 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0928  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.21 
 
 
446 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177592  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3449  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.83 
 
 
444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4670  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  58.94 
 
 
468 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402337  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5279  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  55.99 
 
 
468 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.332035  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1515  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  54.98 
 
 
507 aa  502  1e-141  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0708  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I (cydA, QxtA)  57.14 
 
 
470 aa  498  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1694  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  54.61 
 
 
497 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.199449  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1787  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  54.89 
 
 
481 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0560  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.73 
 
 
476 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000807  putative Cytochrome bd2 subunit I  52.94 
 
 
462 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0092  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  56.88 
 
 
469 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0171  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  56.19 
 
 
471 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.805856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4143  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  56.75 
 
 
474 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4378  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.57 
 
 
468 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3834  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  56.52 
 
 
474 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4010  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  57.89 
 
 
467 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4157  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  53.1 
 
 
474 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129966  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1615  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  54.42 
 
 
484 aa  482  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0740  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  52.57 
 
 
468 aa  480  1e-134  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2425  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  55.03 
 
 
480 aa  479  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1250  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  53.3 
 
 
482 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4927  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  57.82 
 
 
472 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000735116 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3952  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  54.68 
 
 
465 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0206665  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3212  quinol oxidase subunit I QxtA  54.68 
 
 
465 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1025  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  55.1 
 
 
473 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4072  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  53.09 
 
 
473 aa  475  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.508302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0416  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  51.91 
 
 
468 aa  475  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3858  hypothetical protein  56.41 
 
 
465 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.84507  normal  0.940576 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4323  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  56.31 
 
 
478 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5132  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  55.84 
 
 
474 aa  474  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.616127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3593  cytochrome ubiquinol oxidase subunit 1 transmembrane protein  54.13 
 
 
472 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3333  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  55.58 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3927  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  51.95 
 
 
465 aa  460  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>