28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1390 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  51.91 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  55.1 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  39.57 
 
 		 135 aa  67  0.00000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1738  PilT protein domain protein  32.59 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000240428  normal  0.135442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1961  PilT protein domain protein  30.53 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.342986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1760  PilT domain-containing protein  32.35 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  34.07 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1436  hypothetical protein  35.64 
 
 		 133 aa  52  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0608758  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00310  predicted nucleic acid-binding protein, contains PIN domain  24.81 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  32.54 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2139  hypothetical protein  32.26 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804085  normal  0.443514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0806  hypothetical protein  29.63 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0040933  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  33.04 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4442  PilT domain-containing protein  32.29 
 
 		 176 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1214  PilT domain-containing protein  30.25 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  28.36 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2763  hypothetical protein  30.43 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2037  PilT protein domain protein  30.43 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2713  PilT protein domain protein  31.2 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0839377  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  28.23 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0050  hypothetical protein  31.3 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6160  PilT protein domain protein  30.08 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.668901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1017  hypothetical protein  31.62 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.504321  normal  0.760781 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1758  PilT protein  43.18 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>