24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1301 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 103 aa  204  3e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  76 
 
 		 141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  41.84 
 
 		 110 aa  78.2  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  30.11 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  48.15 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  46.6 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  34.38 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  29.17 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  32.98 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  33.7 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2147  DNA polymerase beta domain protein region  35.14 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  30.53 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  35.96 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2641  DNA polymerase beta domain protein region  38.46 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  24.72 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  27.96 
 
 		 113 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 110 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>