257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1241 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1241  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  100 
 
 
147 aa  296  6e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0859  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  56.25 
 
 
147 aa  164  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.43121  normal  0.347651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2335  Ribose/galactose isomerase  47.92 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000733938  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3169  Ribose/galactose isomerase  45.27 
 
 
151 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5839  Ribose/galactose isomerase  47.92 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244714  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  44.53 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4929  sugar-phosphate isomerase RpiB/LacA/LacB family  46.21 
 
 
147 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111227  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.84 
 
 
147 aa  104  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  44.8 
 
 
322 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  38.1 
 
 
148 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.24 
 
 
153 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
370 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  33.11 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  36.05 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  39.84 
 
 
166 aa  97.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.41 
 
 
143 aa  97.4  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  39.06 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  39.06 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.48 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  40.62 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  33.79 
 
 
149 aa  94.7  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  40.8 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.24 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.06 
 
 
144 aa  94.4  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.74 
 
 
149 aa  94  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.06 
 
 
152 aa  94  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  31.03 
 
 
149 aa  93.6  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  39.2 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  40.8 
 
 
150 aa  93.6  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.03 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  45.05 
 
 
144 aa  93.6  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  42.19 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.28 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  39.23 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  40.46 
 
 
148 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  42.31 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.62 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  37.41 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.5 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  34.01 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  34.01 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  34.01 
 
 
151 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  44.8 
 
 
145 aa  90.1  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  41.22 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  33.56 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  42.73 
 
 
145 aa  89  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  48.84 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2314  ribose-5-phosphate isomerase  33.57 
 
 
149 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  37.41 
 
 
152 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.68 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  38.03 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  38.03 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.6 
 
 
149 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2701  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  34.97 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  0.215374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  36.51 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.4  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.18 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  37.32 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  38.28 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3837  ribose-5-phosphate isomerase B  37.5 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  34.81 
 
 
148 aa  86.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  39.06 
 
 
152 aa  86.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2734  ribose 5-phosphate isomerase B  48.08 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.5 
 
 
152 aa  86.3  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  34.38 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2120  ribose-5-phosphate isomerase  36.55 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00298451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.06 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5511  ribose-5-phosphate isomerase B  36.72 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  unclonable  3.6700900000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2745  ribose-5-phosphate isomerase  45.65 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2065  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.71 
 
 
149 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5440  ribose-5-phosphate isomerase B  35.94 
 
 
147 aa  84  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  33.59 
 
 
148 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.5 
 
 
154 aa  83.6  8e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0070  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  36.96 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000149222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  36.24 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1630  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.37 
 
 
566 aa  82.8  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5116  ribose-5-phosphate isomerase B  37.6 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000611048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0972  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.16 
 
 
149 aa  82  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  32.64 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  38.89 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2026  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  37.31 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359244  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0352  ribose 5-phosphate isomerase B  33.6 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1313  ribose 5-phosphate isomerase B  42.06 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000182185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  39.5 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>