258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0859 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0859  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.43121  normal  0.347651 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1241  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  56.25 
 
 
147 aa  164  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3169  Ribose/galactose isomerase  52.35 
 
 
151 aa  137  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2335  Ribose/galactose isomerase  52.08 
 
 
144 aa  128  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000733938  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  48.89 
 
 
149 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  50.4 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.14 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  49.61 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5839  Ribose/galactose isomerase  54.96 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244714  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.78 
 
 
149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  41.38 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4178  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.62 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000811694  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  41.78 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4929  sugar-phosphate isomerase RpiB/LacA/LacB family  52.05 
 
 
147 aa  110  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111227  normal  0.290235 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1017  ribose/galactose isomerase  47.24 
 
 
144 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0396187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.45 
 
 
149 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.55 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.89 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.86 
 
 
370 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  40.69 
 
 
166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.48 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1332  ribose-5-phosphate isomerase  44.09 
 
 
148 aa  106  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  37.84 
 
 
148 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  44.35 
 
 
322 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.37 
 
 
153 aa  104  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2209  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  44.09 
 
 
143 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.922372  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1307  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.52 
 
 
154 aa  103  6e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.833866  normal  0.257706 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  40.32 
 
 
149 aa  103  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  38.19 
 
 
149 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  42.52 
 
 
148 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1359  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.31 
 
 
144 aa  102  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1042  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.94 
 
 
142 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000715199  hitchhiker  0.000018847 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1258  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.73 
 
 
144 aa  102  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000876493  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  44.09 
 
 
149 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.8 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  36.55 
 
 
148 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1322  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.52 
 
 
142 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  38.62 
 
 
157 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  43.55 
 
 
148 aa  100  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0901  ribose/galactose isomerase  41.94 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.16 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2026  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.04 
 
 
161 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359244  normal  0.295669 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  39.22 
 
 
164 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.31 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0757  ribose-5-phosphate isomerase B  35.17 
 
 
148 aa  97.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.41 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0792  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.28 
 
 
150 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0447104  normal  0.0700549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  37.06 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  35.86 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  40.28 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.59 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D05  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  39.26 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.305214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3103  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.04 
 
 
151 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00677478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  34.97 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  39.86 
 
 
148 aa  94.7  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.4 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1794  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  37.09 
 
 
171 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.623849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4556  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1116  ribose-5-phosphate isomerase B  40 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.177801  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  36.73 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3746  ribose-5-phosphate isomerase B  37.12 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  41.27 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
152 aa  94  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2239  ribose-5-phosphate isomerase  43.51 
 
 
145 aa  94  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0170  ribose-5-phosphate isomerase  44.09 
 
 
148 aa  93.6  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1933  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000691154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  37.01 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2093  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.72 
 
 
171 aa  93.2  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.6 
 
 
142 aa  93.2  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  35.81 
 
 
146 aa  92  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  37.33 
 
 
148 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  41.27 
 
 
152 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0790  ribose 5-phosphate isomerase B  43.55 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1930  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  37.59 
 
 
171 aa  91.7  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00064088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0559  ribose 5-phosphate isomerase B  38.93 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1034  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.48 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.257274 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1182  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  41.94 
 
 
145 aa  90.9  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  39.26 
 
 
153 aa  90.1  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_002936  DET0643  ribose-5-phosphate isomerase B  37.31 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0677  ribose-5-phosphate isomerase B  37.31 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2450  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  35.25 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.618106 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  36.57 
 
 
152 aa  90.1  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0842  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.99 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_583  ribose-5-phosphate isomerase-like protein  36.57 
 
 
154 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1159  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.67 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.832991 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2264  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  37.59 
 
 
171 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  35.37 
 
 
156 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0792  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.89 
 
 
140 aa  89  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2225  galactose-6-phosphate isomerase subunit LacB  37.59 
 
 
171 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>