More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3224 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3224  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
336 aa  670    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1527  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
334 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
346 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.540353  hitchhiker  0.0000619803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4296  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.28 
 
 
356 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02830  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  43.34 
 
 
395 aa  239  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.562739  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.12 
 
 
379 aa  238  6.999999999999999e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2060  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  39.81 
 
 
356 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1336  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.84 
 
 
344 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0601175  normal  0.898659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0649  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.59 
 
 
354 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0753828  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6833  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.18 
 
 
353 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0616  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.23 
 
 
344 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2037  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40 
 
 
360 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.820992  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0753  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.61 
 
 
349 aa  227  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4680  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.82 
 
 
347 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.706752  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0229  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.76 
 
 
350 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.15 
 
 
346 aa  226  4e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.44511  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0902  hypothetical protein  36.26 
 
 
352 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0933  hypothetical protein  35.96 
 
 
352 aa  225  6e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0758  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.61 
 
 
349 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.571956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2157  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  39.33 
 
 
357 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.335235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0803  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.38 
 
 
351 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2535  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.43 
 
 
350 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0257  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.76 
 
 
350 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7569  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
352 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4186  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.38 
 
 
417 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000141548  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3054  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 
352 aa  222  8e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2163  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.82 
 
 
350 aa  221  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0211333  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0624  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.11 
 
 
365 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2457  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.01 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0809825  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2384  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  34.29 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.25475  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1788  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.25 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149813  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1130  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.85 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2121  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.16 
 
 
357 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406084  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1790  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.3 
 
 
354 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.316766  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0155  enoyl-CoA hydratase  40.65 
 
 
343 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3165  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.68 
 
 
334 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2132  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.66 
 
 
351 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00488418  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1751  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  41.49 
 
 
348 aa  215  8e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.42983 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3002  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.85 
 
 
351 aa  215  9e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0905193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2118  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.95 
 
 
351 aa  215  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2375  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.66 
 
 
351 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1732  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.03 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.942683  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1834  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.76 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0903  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
350 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2195  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.66 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2356  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  32.66 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2884  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.53 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3936  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.91 
 
 
357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2322  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  33.14 
 
 
351 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4230  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.42 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3783  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.05 
 
 
353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0969949  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4155  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.42 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4386  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  40.42 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230792  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0421  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  42.09 
 
 
370 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1543  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.62 
 
 
355 aa  210  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0256102  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2864  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 
368 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.298251  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2557  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.5 
 
 
357 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3092  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.19 
 
 
357 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.221935 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3491  enoly-coenzyme A hydratase/isomerase family protein  33.14 
 
 
357 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3300  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  41.16 
 
 
357 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4237  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
386 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4607  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.47 
 
 
444 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.685033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2437  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.75 
 
 
356 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484905  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2280  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.85 
 
 
357 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0859  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.72 
 
 
348 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209599  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0719  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
379 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33689  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11089  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.32 
 
 
345 aa  202  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554975  normal  0.656952 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.47 
 
 
335 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130817  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1556  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.76 
 
 
350 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.615886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0923  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.48 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451836  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0831  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.48 
 
 
382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2183  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  38.48 
 
 
382 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2130  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
361 aa  200  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0313318  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 
379 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.611777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4380  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 
379 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.12865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4756  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.84 
 
 
409 aa  198  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.977722 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.298082  normal  0.0486568 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3591  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.98 
 
 
345 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.35469  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1798  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  37.89 
 
 
380 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1770  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
365 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5328  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
379 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0116155  normal  0.0410318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5131  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.64 
 
 
383 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.469917  normal  0.668037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4173  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.8 
 
 
355 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3409  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
379 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.359557  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.63 
 
 
379 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.260667 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01520  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  36.55 
 
 
359 aa  194  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.801098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3705  enoly-CoA hydratase/isomerase family protein  34.5 
 
 
365 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0631  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.92 
 
 
359 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1455  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.19 
 
 
356 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3580  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.5 
 
 
350 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1089  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  33.91 
 
 
382 aa  192  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0147418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3571  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.66 
 
 
429 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21060  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.86 
 
 
363 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10690  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.57 
 
 
360 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206594  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6082  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.66 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2022  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  37.04 
 
 
383 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1131  3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase  38.24 
 
 
414 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663045  normal  0.545416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3052  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.78 
 
 
350 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2887  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32 
 
 
355 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1102  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.32 
 
 
347 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>