35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0155 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  100 
 
 		 147 aa  280  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  120  4e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  44.37 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  43.36 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  45.45 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  45.45 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  45.45 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  45.45 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  45.45 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  44.76 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  42.66 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  43.36 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  38.46 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  34.23 
 
 		 167 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  36.55 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  39.16 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  38.46 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.47 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  38.46 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  37.76 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  29.79 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  35.25 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.97 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  33.79 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  35.25 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  28.15 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2823  putative tricarboxylic transport membrane protein  34.86 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0616705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  27.66 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3785  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.79 
 
 		 144 aa  41.2  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  33.33 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  25.17 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2222  putative tricarboxylic transporter, TctB (4TM)subunit  27.56 
 
 		 172 aa  40  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0953872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  30.71 
 
 		 168 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>