More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3061 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3061  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  100 
 
 		 335 aa  654    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122526  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2046  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  56.84 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2606  alcohol dehydrogenase  52.89 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.836492  hitchhiker  0.00218108 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1073  alcohol dehydrogenase  54.3 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3017  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  51.23 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.295678 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3572  alcohol dehydrogenase  48.17 
 
 		 326 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1202  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.88 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1612  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.72 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000615843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2930  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.3 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1341  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.43 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000434756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1723  quinone oxidoreductase  48.16 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2493  zinc-binding alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 		 326 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1788  hypothetical protein  47.85 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0271  alcohol dehydrogenase  45.73 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1035  alcohol dehydrogenase  43.73 
 
 		 326 aa  263  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0260  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.3 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0249  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.98 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0608751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0250  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001990  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 326 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0396  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family protein  44.52 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0463  quinone oxidoreductase  44.52 
 
 		 325 aa  262  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.152247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3346  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  46.06 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.584462  normal  0.149022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0254  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.82 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0178  YhdH/YhfP family quinone oxidoreductase  47.11 
 
 		 326 aa  262  6.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000873043  normal  0.604397 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3679  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.85 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0862676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00458  alcohol dehydrogenase  44.82 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1200  putative quinone oxidoreductase  44.19 
 
 		 325 aa  260  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0700296  normal  0.0860145 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1675  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.37 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  47.88 
 
 		 588 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3356  quinone oxidoreductase  42.99 
 
 		 327 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0638936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0252  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.21 
 
 		 326 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3530  alcohol dehydrogenase  44.51 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0359  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.77 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000624901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0255  quinone oxidoreductase  44.21 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1586  alcohol dehydrogenase  45.09 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2363  alcohol dehydrogenase  45.35 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.949479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0272  quinone oxidoreductase  46.75 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000568585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4337  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  43.9 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270219  normal  0.0883749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0808  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.73 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2846  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.55 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0354021  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0309  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.24 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0467  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.38 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2365  quinone oxidoreductase  45.83 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1505  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  44.82 
 
 		 330 aa  256  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0752  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  39.58 
 
 		 330 aa  255  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5139  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  42.86 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1419  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.87 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.53 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.351283  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3519  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.95 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.231356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2364  dehydrogenase NAD(P)-binding domain-containing protein  43.47 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3408  alcohol dehydrogenase  42.02 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0454  quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0267753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3941  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.65 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3443  quinone oxidoreductase  45.93 
 
 		 324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378871  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2753  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.69 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.700456  normal  0.0252326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3689  alcohol dehydrogenase  46.51 
 
 		 324 aa  251  9.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0316802  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03112  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  45.6 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0728423  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0454  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.6 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.749607  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03063  hypothetical protein  45.6 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0710671  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2504  alcohol dehydrogenase  44.65 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0137334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3737  quinone oxidoreductase  45.28 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000296751  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5461  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3548  quinone oxidoreductase  45.6 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000395647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4569  quinone oxidoreductase, YhdH family  45.28 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000284525  normal  0.204185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2154  alcohol dehydrogenase  43.9 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.573953  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5401  alcohol dehydrogenase  42.99 
 
 		 327 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00910947 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0181  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  45.81 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2475  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.41 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3502  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  42.99 
 
 		 328 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.990659  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1210  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.783737  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6206  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.69 
 
 		 328 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1052  quinone oxidoreductase  44.51 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5289  quinone oxidoreductase  42.68 
 
 		 327 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.574483  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3205  alcohol dehydrogenase  43.07 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147594 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2231  alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.499373  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3285  quinone oxidoreductase, YhdH family  44.95 
 
 		 324 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00682496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4497  putative quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.07 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0178815  hitchhiker  0.00000000000130084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4413  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  44.58 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00493012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3877  quinone oxidoreductase  46.93 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161114  normal  0.0453412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4477  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  40.92 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000206096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1526  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.59 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1643  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.561484  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1230  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.04 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1510  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  41.74 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2229  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.95 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.979693 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1223  quinone oxidoreductase  43.08 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6131  zinc-binding alcohol dehydrogenase  43.81 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1108  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.588532  normal  0.604429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3700  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  43.43 
 
 		 327 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4187  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  46.93 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3679  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  41.34 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1185  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  43.56 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4744  alcohol dehydrogenase  42.38 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0556  alcohol dehydrogenase  46.2 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0105  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.63 
 
 		 328 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.227745  normal  0.886782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2995  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.44 
 
 		 331 aa  246  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00123098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4334  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  44.95 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.511675  normal  0.564887 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2819  quinone oxidoreductase putative YhdH/YhfP  45.12 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18460  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  41.77 
 
 		 327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4991  alcohol dehydrogenase  42.94 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>