75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2976 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  100 
 
 		 342 aa  660    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  47.25 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  39.49 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  37.46 
 
 		 328 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  37.46 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3208  high-affinity nickel-transporter  41.34 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  37.46 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  37.12 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  36.79 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2711  high-affinity nickel-transporter  38.63 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.733355  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  38.57 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4841  high-affinity nickel-transporter  37.12 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4543  high-affinity nickel-transporter  36.3 
 
 		 398 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.47672  normal  0.619069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  35.79 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3031  high-affinity nickel-transporter  35.66 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  35.55 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  35.99 
 
 		 358 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  34.07 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  37.09 
 
 		 340 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  33.45 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  33.45 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  33.45 
 
 		 340 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  37.05 
 
 		 345 aa  149  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  34.75 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0860  high-affinity nickel-transporter  36.22 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  33.64 
 
 		 367 aa  142  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  34.83 
 
 		 389 aa  142  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0088  hypothetical protein  32.51 
 
 		 360 aa  142  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0096  hypothetical protein  32.51 
 
 		 367 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.977897  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1782  high-affinity nickel-transporter  36.82 
 
 		 346 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1976  putative nickel transporter  30 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  32.63 
 
 		 349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2905  high-affinity nickel-transporter  33.51 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  34.77 
 
 		 342 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1398  high-affinity nickel-transporter  40.28 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0677472  normal  0.0633291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  37.8 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0081  high-affinity nickel-transporter  32.51 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.940198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1678  high-affinity nickel-transporter  40.35 
 
 		 337 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0510109  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  40 
 
 		 314 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  38.16 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1403  high-affinity nickel-transporter  40 
 
 		 337 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.198577  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  28.69 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2245  high-affinity nickel-transporter  39.73 
 
 		 330 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0277  high-affinity nickel-transporter  37.94 
 
 		 337 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66329  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4270  high-affinity nickel-transporter  30.4 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.577048  normal  0.743573 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  24.03 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1737  high-affinity nickel-transporter  31.38 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.284781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0942  high-affinity nickel-transporter  36.57 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0338054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1353  putative high affinity nickel transporter  35.56 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.85251  normal  0.315811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  26.67 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  24.22 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2333  high-affinity nickel-transporter  34.63 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144614  normal  0.152273 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0753  high-affinity nickel-transporter  33.33 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000315045  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  24.28 
 
 		 513 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5609  high-affinity nickel-transporter  27.8 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.437019 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  21.35 
 
 		 497 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  23.65 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  18.78 
 
 		 490 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2532  putative nickel ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 		 236 aa  53.5  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0439363  normal  0.195103 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  21.97 
 
 		 505 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3677  high-affinity nickel-transporter  30.23 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.841534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0067  nickel/cobalt efflux protein RcnA  22.22 
 
 		 300 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4158  high-affinity nickel-transporter  28.85 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0568416  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1407  high-affinity nickel-transporter  21.27 
 
 		 208 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2931  nickel/cobalt efflux protein RcnA  21.86 
 
 		 289 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0470601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6502  high-affinity nickel-transporter  32.73 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.971556  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  29.22 
 
 		 239 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1269  high-affinity nickel-transporter  21.6 
 
 		 208 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0687  high-affinity nickel-transporter  21.5 
 
 		 208 aa  46.2  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.471352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2530  high-affinity nickel-transporter  33.04 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.943623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3177  nickel/cobalt efflux protein RcnA  20.76 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.508433  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3256  nickel/cobalt efflux protein RcnA  20.76 
 
 		 274 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0374034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3167  high-affinity nickel-transporter  24.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0258449  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3193  nickel/cobalt efflux protein RcnA  21.31 
 
 		 282 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4225  high-affinity nickel-transporter  30.61 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786364  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>