34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0741 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0741  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 111 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0516  putative anti-sigma B factor antagonist  36.36 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.144727  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1142  putative anti-anti-sigma factor  36.36 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0452  putative anti-anti-sigma factor  36.36 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0606923  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4356  anti-sigma-factor antagonist  38.3 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.36645  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3804  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.002729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  37.04 
 
 		 109 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3627  STAS domain-containing protein  37.37 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010517  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1966  STAS domain-containing protein  36.59 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.104039  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2116  anti-sigma-factor antagonist  34.09 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0285  hypothetical protein  34.34 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0162  hypothetical protein  39.66 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3570  putative anti-sigma factor antagonist  34.34 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3606  putative anti-sigma factor antagonist  34.34 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3501  putative anti-sigma factor antagonist  34.34 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.786716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0509  conserved hypothetical protein containing  28.87 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3499  putative anti-sigma factor antagonist  34.34 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0282325  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0341  hypothetical protein  39.66 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.516535  normal  0.750454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3077  SpoIIAA family protein  36.36 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.181155 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3668  hypothetical protein  34.34 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.309815  normal  0.0348045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0292  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2219  anti-sigma-factor antagonist  37.62 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002413  putative anti-sigma B factor antagonist  25.81 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2783  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  28.72 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.309096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03182  STAS domain protein  32.98 
 
 		 102 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0500  SpoIIAA family protein  34.41 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000649364  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03654  hypothetical protein  24.47 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0382  anti-sigma-factor antagonist  35.11 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.9374  normal  0.215412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0737  SpoIIAA family protein  33.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.293777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4229  anti-sigma-factor antagonist  27.18 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0519938  hitchhiker  0.000220206 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3605  SpoIIAA family protein  28.57 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4020  hypothetical protein  41.05 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.164835  normal  0.180703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1306  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.29 
 
 		 128 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  46.3 
 
 		 375 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>