17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1350 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.588656  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  46.28 
 
 		 1609 aa  169  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  46.39 
 
 		 1613 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  43.09 
 
 		 1615 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  47.75 
 
 		 1560 aa  156  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0378  helicase domain-containing protein  45.32 
 
 		 475 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  43.22 
 
 		 1636 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  41.8 
 
 		 1847 aa  149  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  42.23 
 
 		 1632 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3139  helicase domain-containing protein  35.29 
 
 		 576 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1937  superfamily II DNA/RNA helicase  38.1 
 
 		 1024 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00156892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2194  superfamily II DNA/RNA helicase  40.69 
 
 		 1021 aa  122  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1662  adenine specific DNA methyltransferase  34.54 
 
 		 1005 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0066  hypothetical protein  40.36 
 
 		 165 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0961  hypothetical protein  35 
 
 		 110 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298352  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0340  adenine specific DNA methyltransferase  28.97 
 
 		 1064 aa  42.7  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0570393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1196  adenine specific DNA methyltransferase  38.89 
 
 		 1059 aa  42  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000965363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>