51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4520 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4520  reverse transcriptase-like  100 
 
 		 91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0240  RNA-directed DNA polymerase  70.33 
 
 		 634 aa  134  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816988  normal  0.0174648 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3305  RNA-directed DNA polymerase  68.13 
 
 		 635 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0239  RNA-directed DNA polymerase  68.13 
 
 		 635 aa  130  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.114729  normal  0.0192073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3634  RNA-directed DNA polymerase  71.08 
 
 		 554 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.668654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2438  group II intron, maturase-specific  67.03 
 
 		 338 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0356314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1119  group II intron, maturase-specific  67.03 
 
 		 338 aa  129  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0426  RNA-directed DNA polymerase  68.67 
 
 		 589 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350523  decreased coverage  0.00346836 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3286  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  48.86 
 
 		 596 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0460784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1400  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.55 
 
 		 607 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1402  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.55 
 
 		 607 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2962  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.55 
 
 		 607 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2964  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  50.55 
 
 		 607 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0432  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.81 
 
 		 502 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4800  group II intron, maturase-specific  59.15 
 
 		 666 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.256541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4335  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  42.86 
 
 		 661 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0968  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.58 
 
 		 648 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.239454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3336  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  41.58 
 
 		 648 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0014  RNA-directed DNA polymerase  45.68 
 
 		 627 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0033  RNA-directed DNA polymerase  45.68 
 
 		 627 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.590524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3637  reverse transcriptase-like  69.05 
 
 		 48 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4730  group II intron, maturase-specific  40.32 
 
 		 449 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0690  RNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 576 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0182771  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2039  RNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 592 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2004  RNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 576 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0765  RNA-directed DNA polymerase  37.31 
 
 		 576 aa  49.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0196  RNA-directed DNA polymerase  39.13 
 
 		 553 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0063  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.904418 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0075  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3429  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3351  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.27608  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0091  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3345  reverse transcriptase/endonuclease protein  39.71 
 
 		 548 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0135  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 560 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.994203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4791  RNA-directed DNA polymerase  41.54 
 
 		 560 aa  45.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1102  RNA-directed DNA polymerase  35.48 
 
 		 495 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.127965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3124  RNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 487 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.125839  unclonable  0.0000204119 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0556  RNA-directed DNA polymerase  35.53 
 
 		 549 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1335  RNA-directed DNA polymerase  37.68 
 
 		 490 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104079  normal  0.0206218 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1207  RNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0557529  normal  0.0455501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2784  RNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.352446 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2646  RNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.807029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2134  RNA-directed DNA polymerase  36.36 
 
 		 490 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.0852814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0654  RNA-directed DNA polymerase  36.23 
 
 		 544 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  37.14 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4731  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  35.21 
 
 		 437 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2883  RNA-directed DNA polymerase  32.89 
 
 		 566 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.127165 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7464  RNA-directed DNA polymerase  41.07 
 
 		 503 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.685667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1354  RNA-directed DNA polymerase  35.06 
 
 		 495 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0651  RNA-directed DNA polymerase  36.05 
 
 		 490 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.574697  normal  0.320741 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0949  RNA-directed DNA polymerase  36.62 
 
 		 569 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22082  normal  0.366472 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>