More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2990 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2990  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 127 aa  250  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.974488  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0713  30S ribosomal protein S13  88.89 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000350202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2581  30S ribosomal protein S13  85.71 
 
 		 126 aa  194  4.0000000000000005e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 125 aa  185  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2211  30S ribosomal protein S13  81.45 
 
 		 125 aa  183  6e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3725  30S ribosomal protein S13  80.31 
 
 		 127 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  69.84 
 
 		 126 aa  181  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0230  30S ribosomal protein S13  80.31 
 
 		 127 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0227  30S ribosomal protein S13  80.31 
 
 		 127 aa  180  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000782348  normal  0.0233895 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  72.95 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  65.87 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  65.87 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  66.39 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  65.08 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  63.71 
 
 		 124 aa  166  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1314  30S ribosomal protein S13  79.21 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  163  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  64.29 
 
 		 126 aa  163  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 126 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2657  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  61.79 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0355  30S ribosomal protein S13  74.59 
 
 		 121 aa  161  3e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  65.29 
 
 		 121 aa  160  4.0000000000000004e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  69.49 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  64.23 
 
 		 125 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  61.11 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  62.1 
 
 		 125 aa  160  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 124 aa  160  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 123 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 124 aa  160  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  65 
 
 		 121 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  65.32 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 		 121 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2628  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 127 aa  157  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  156  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  59.68 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  155  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  61.98 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17291  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  63.41 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  154  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17451  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  154  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17191  30S ribosomal protein S13  71.31 
 
 		 121 aa  154  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  154  6e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23241  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 127 aa  153  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  153  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  7e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  152  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16920  SSU ribosomal protein S13P  59.84 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  62.9 
 
 		 125 aa  153  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1976  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.515253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23550  SSU ribosomal protein S13P  61.48 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  63.25 
 
 		 126 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16571  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.725711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1630  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>