57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4524 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4524  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  431  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0020  transcriptional regulator, XRE family  36.12 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0021  transcriptional regulator, XRE family  34.51 
 
 		 298 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2091  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  32.11 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  33.15 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1905  putative regulatory protein  33.87 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230258  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1294  helix-turn-helix domain protein  34.95 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  32.02 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  29.78 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  21.01 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  26.74 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 289 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  29.87 
 
 		 291 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  27.22 
 
 		 289 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.55 
 
 		 284 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.57 
 
 		 278 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  27.98 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  28.33 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  29.52 
 
 		 285 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  28.89 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  24.44 
 
 		 293 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  31.03 
 
 		 280 aa  48.5  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1479  hypothetical protein  31.14 
 
 		 284 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1433  hypothetical protein  41.59 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.669776  hitchhiker  0.000487487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3658  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.877155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 		 287 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.63 
 
 		 292 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  33.04 
 
 		 284 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  45.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0255741  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  24.49 
 
 		 291 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  31.03 
 
 		 284 aa  45.1  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  25.45 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  24.39 
 
 		 293 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  26.55 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 288 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  34.31 
 
 		 291 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 293 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 267 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  31.21 
 
 		 280 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1898  hypothetical protein  36.52 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.414161  normal  0.243648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 293 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  28.73 
 
 		 287 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 287 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  28.33 
 
 		 286 aa  42  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  31.37 
 
 		 288 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  26.97 
 
 		 285 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36600  Helix-turn-helix protein  30.71 
 
 		 302 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0503658  normal  0.196065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  30.97 
 
 		 301 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>