117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4454 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4454  protein of unknown function DUF397  100 
 
 
69 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0441  protein of unknown function DUF397  53.45 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2071  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.392038  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7763  hypothetical protein  49.18 
 
 
68 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0718  protein of unknown function DUF397  46.88 
 
 
73 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24730  protein of unknown function (DUF397)  48.48 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0487  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
63 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1304  protein of unknown function DUF397  51.72 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0379944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2127  protein of unknown function DUF397  39.51 
 
 
110 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000239677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3776  protein of unknown function DUF397  42.62 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4695  protein of unknown function DUF397  45 
 
 
127 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1230  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.375294 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0228  hypothetical protein  43.08 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0037  hypothetical protein  46.67 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727174  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0042  hypothetical protein  46.67 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3778  protein of unknown function DUF397  44.26 
 
 
66 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8369  hypothetical protein  47.69 
 
 
67 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1897  hypothetical protein  47.46 
 
 
64 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422  normal  0.225792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1295  hypothetical protein  48.33 
 
 
78 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3357  hypothetical protein  58.7 
 
 
64 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411145  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0485  protein of unknown function DUF397  41.51 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1230  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
64 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0779142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1413  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2703  hypothetical protein  47.54 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1416  hypothetical protein  48.28 
 
 
63 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0509701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3779  protein of unknown function DUF397  36.07 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4609  protein of unknown function DUF397  51.85 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1786  hypothetical protein  44.83 
 
 
63 aa  50.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3445  hypothetical protein  46.67 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0993  hypothetical protein  40 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3236  hypothetical protein  48.28 
 
 
63 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0513  hypothetical protein  44.26 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.47229  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1159  hypothetical protein  47.27 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0339608  unclonable  0.0000000343885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1379  hypothetical protein  48.28 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.383201  hitchhiker  0.00799748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1432  hypothetical protein  45 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353493  hitchhiker  0.000418088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2128  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1627  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
59 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0673  protein of unknown function DUF397  47.17 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2448  hypothetical protein  48.33 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14038  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0486  protein of unknown function DUF397  34.48 
 
 
63 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0716  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3780  protein of unknown function DUF397  39.06 
 
 
66 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4159  protein of unknown function DUF397  39.66 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0927  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1162  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
62 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.490498  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0099  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0419317  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1834  protein of unknown function DUF397  43.1 
 
 
59 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7976  hypothetical protein  39.13 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0545278  normal  0.164909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5396  protein of unknown function DUF397  66.67 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.051071  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3657  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1229  protein of unknown function DUF397  44.83 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0775452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2539  protein of unknown function DUF397  41.82 
 
 
60 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000183418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3503  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0535915  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0235  hypothetical protein  46.77 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3649  protein of unknown function DUF397  46.43 
 
 
75 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2513  hypothetical protein  45.16 
 
 
78 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4075  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6706  protein of unknown function DUF397  43.64 
 
 
59 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2305  putative regulator  39.68 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1781  hypothetical protein  41.94 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.134477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1329  hypothetical protein  44.26 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2969  hypothetical protein  45.76 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000849623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7828  hypothetical protein  46.67 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6374  protein of unknown function DUF397  43.86 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0372  protein of unknown function DUF397  40.35 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3777  protein of unknown function DUF397  41.38 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4087  protein of unknown function DUF397  37.5 
 
 
60 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1943  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
55 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1504  protein of unknown function DUF397  42.86 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2689  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00137319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1019  hypothetical protein  39.19 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0103  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3743  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4463  hypothetical protein  45.65 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2601  hypothetical protein  45 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0203178  normal  0.0405865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1480  protein of unknown function DUF397  48.08 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3155  protein of unknown function DUF397  36.36 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.093301  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0397  hypothetical protein  49.23 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0643  hypothetical protein  43.33 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1132  hypothetical protein  47.37 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6122  protein of unknown function DUF397  38.6 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.464343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4781  protein of unknown function DUF397  36.21 
 
 
64 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0037  hypothetical protein  41.38 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6482  hypothetical protein  40.79 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.435568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7003  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1161  protein of unknown function DUF397  42.11 
 
 
62 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.653899  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4153  protein of unknown function DUF397  43.33 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4124  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5679  protein of unknown function DUF397  42.59 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6435  protein of unknown function DUF397  43.14 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2538  protein of unknown function DUF397  38.18 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0973  hypothetical protein  44.83 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2090  hypothetical protein  45.83 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161003  normal  0.0235666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0567  protein of unknown function DUF397  54.55 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2231  hypothetical protein  48.94 
 
 
79 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0143015  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2541  protein of unknown function DUF397  39.62 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000122631  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6649  hypothetical protein  40.98 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.476212  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4579  protein of unknown function DUF397  43.55 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1269  hypothetical protein  43.4 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1517  hypothetical protein  41.82 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0185029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2540  protein of unknown function DUF397  40.74 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000021023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>