More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4220 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4220  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
295 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1244  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  84.64 
 
 
291 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.345661  normal  0.0101551 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0655  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  83.33 
 
 
291 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.374362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3812  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80.2 
 
 
295 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0605  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.66 
 
 
295 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.25955  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4202  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.86 
 
 
295 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.886218  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7986  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  80 
 
 
295 aa  480  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  81.85 
 
 
292 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04930  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.66 
 
 
295 aa  482  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861039  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4423  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  79.79 
 
 
292 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.690796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1266  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  82.35 
 
 
293 aa  473  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0021014  normal  0.775706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0381  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.82 
 
 
295 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5979  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.64 
 
 
290 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0361714  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07740  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  77.7 
 
 
297 aa  462  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.55116  normal  0.434158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6507  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  78.64 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0061  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.77 
 
 
292 aa  457  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4116  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  78.42 
 
 
312 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0652  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  79.32 
 
 
290 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.413913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10970  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.67 
 
 
303 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107205  normal  0.560445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0816  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  74.67 
 
 
300 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1342  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.37 
 
 
304 aa  441  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.077758  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2536  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  77.47 
 
 
292 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.269234 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3998  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.33 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0147811  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4706  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  76.25 
 
 
300 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4326  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.59 
 
 
300 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4412  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.59 
 
 
300 aa  435  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00673609  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3016  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.82 
 
 
296 aa  431  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0145094  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1866  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.67 
 
 
300 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0557225 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0728  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  72.39 
 
 
298 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3310  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  75 
 
 
300 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  75.51 
 
 
296 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0994579  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28150  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  75.08 
 
 
296 aa  425  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4869  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.33 
 
 
300 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.300711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3589  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.06 
 
 
297 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.67 
 
 
300 aa  413  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0672  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  72.97 
 
 
297 aa  407  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.267798 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04280  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  73.27 
 
 
306 aa  398  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.844796  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0457  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.42 
 
 
303 aa  365  1e-100  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.355464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1275  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  57.48 
 
 
292 aa  328  8e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.43914  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.44 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.44 
 
 
290 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.22 
 
 
308 aa  309  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.22 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  52.56 
 
 
291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0115  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.22 
 
 
291 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.06 
 
 
339 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.86 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.54 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.19 
 
 
291 aa  301  7.000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.42 
 
 
296 aa  301  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.58 
 
 
290 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.53 
 
 
291 aa  299  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.08 
 
 
290 aa  297  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.86 
 
 
289 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5544  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.4 
 
 
291 aa  297  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.72 
 
 
290 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.72 
 
 
290 aa  297  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.72 
 
 
290 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.86 
 
 
289 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.86 
 
 
289 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.86 
 
 
289 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.86 
 
 
289 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.84 
 
 
293 aa  297  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.85 
 
 
290 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.03 
 
 
290 aa  296  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.85 
 
 
290 aa  295  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0774  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.71 
 
 
286 aa  296  4e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0098  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.02 
 
 
294 aa  296  4e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.126064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.17 
 
 
290 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  50.17 
 
 
290 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0288  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  54.14 
 
 
290 aa  295  8e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.2 
 
 
289 aa  295  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.36 
 
 
290 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0246  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.01 
 
 
298 aa  293  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.54 
 
 
293 aa  293  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.92 
 
 
290 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.88 
 
 
290 aa  293  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2222  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  52.4 
 
 
290 aa  293  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0851667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  52.04 
 
 
290 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  50.34 
 
 
291 aa  293  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  53.92 
 
 
290 aa  293  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  53.92 
 
 
290 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.19 
 
 
300 aa  292  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  52.81 
 
 
300 aa  292  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  53.24 
 
 
290 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  51.35 
 
 
329 aa  292  6e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0956  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  52.04 
 
 
290 aa  292  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.36 
 
 
290 aa  291  8e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  51.36 
 
 
290 aa  291  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0073  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  55.12 
 
 
289 aa  291  9e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  48.47 
 
 
291 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  0.0000000231889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>