More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1179 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00391  DNA-binding ATP-dependent protease La  60.65 
 
 		 784 aa  957    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3170  ATP-dependent protease La  60.65 
 
 		 784 aa  957    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  43.6 
 
 		 768 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1790  ATP-dependent protease La  54.01 
 
 		 807 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  49.61 
 
 		 819 aa  762    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2302  ATP-dependent protease La  60.23 
 
 		 798 aa  958    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.235792  hitchhiker  0.000494744 
 
 
-
 
NC_002950  PG0620  ATP-dependent protease La  44.13 
 
 		 810 aa  648    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  59.45 
 
 		 809 aa  946    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0317  ATP-dependent protease La  49.68 
 
 		 817 aa  769    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  59.53 
 
 		 806 aa  940    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4561  ATP-dependent protease La 1  51.51 
 
 		 773 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3783  ATP-dependent protease La  59.13 
 
 		 782 aa  946    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.417007  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1106  ATP-dependent protease La  55.88 
 
 		 812 aa  877    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521594  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1796  ATP-dependent protease La  61.37 
 
 		 785 aa  963    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3724  ATP-dependent protease La  59.92 
 
 		 798 aa  959    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.639562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  51.64 
 
 		 776 aa  790    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4203  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  51.51 
 
 		 776 aa  790    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000103757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4214  endopeptidase La (ATP-dependent protease La 1)  51.51 
 
 		 776 aa  792    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000107008  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  58.84 
 
 		 805 aa  932    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1827  hypothetical protein  58.09 
 
 		 816 aa  929    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1823  hypothetical protein  58.09 
 
 		 816 aa  927    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1749  peptidase S16, ATP-dependent protease La  59.92 
 
 		 798 aa  961    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0163826 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1659  Lon-A peptidase  50.64 
 
 		 875 aa  765    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.241054  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  56.6 
 
 		 804 aa  888    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  59.55 
 
 		 803 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0204  Lon-A peptidase  49.15 
 
 		 801 aa  770    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  59.37 
 
 		 805 aa  940    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1897  peptidase S16, ATP-dependent protease La  56.28 
 
 		 808 aa  884    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  58.84 
 
 		 805 aa  932    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1674  peptidase S16, ATP-dependent protease La  58.51 
 
 		 812 aa  930    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3695  Lon-A peptidase  60.15 
 
 		 798 aa  964    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2806  Lon-A peptidase  56.14 
 
 		 802 aa  884    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  44.6 
 
 		 780 aa  700    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  52.16 
 
 		 801 aa  825    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  59.08 
 
 		 807 aa  919    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1871  Lon-A peptidase  54.27 
 
 		 805 aa  836    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00061331  normal  0.0162065 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  43.57 
 
 		 774 aa  656    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  48.24 
 
 		 823 aa  749    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2218  Lon-A peptidase  49.73 
 
 		 819 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  45.71 
 
 		 809 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 815 aa  1660    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4702  ATP-dependent protease La 1  51.64 
 
 		 773 aa  790    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  45.81 
 
 		 816 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  59.16 
 
 		 803 aa  953    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1552  Lon-A peptidase  57.18 
 
 		 806 aa  886    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  49.54 
 
 		 768 aa  770    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  58.38 
 
 		 806 aa  934    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  47.92 
 
 		 843 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3350  Lon-A peptidase  53.47 
 
 		 812 aa  810    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2565  ATP-dependent protease La  56.15 
 
 		 812 aa  888    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.498787  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1361  Lon-A peptidase  55.05 
 
 		 803 aa  843    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0347  ATP-dependent protease La  47.02 
 
 		 826 aa  724    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.308867  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0899  ATP-dependent protease La  48.9 
 
 		 802 aa  764    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  53.88 
 
 		 799 aa  845    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  56.4 
 
 		 813 aa  890    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  43.92 
 
 		 797 aa  654    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  59.35 
 
 		 805 aa  944    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2394  ATP-dependent protease La  55.5 
 
 		 823 aa  868    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.118165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  59.46 
 
 		 811 aa  977    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1732  ATP-dependent protease La  49.87 
 
 		 821 aa  764    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.594571  normal  0.282215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  58.07 
 
 		 809 aa  916    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  58.83 
 
 		 807 aa  925    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2493  ATP-dependent protease La  60.97 
 
 		 783 aa  964    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000146156  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2892  ATP-dependent protease La  56.15 
 
 		 812 aa  887    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.169901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2044  Lon-A peptidase  56.65 
 
 		 802 aa  910    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  56.41 
 
 		 807 aa  887    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1899  ATP-dependent protease La  50.64 
 
 		 874 aa  766    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.67239  normal  0.195756 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  59.29 
 
 		 803 aa  919    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0263  DNA-binding ATP-dependent protease La  58.04 
 
 		 784 aa  917    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  51.54 
 
 		 798 aa  810    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  45.38 
 
 		 814 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  57.14 
 
 		 809 aa  917    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  44.5 
 
 		 813 aa  685    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0775  Lon-A peptidase  56.84 
 
 		 802 aa  891    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577145  normal  0.0448115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0798  ATP-dependent protease La  53.41 
 
 		 798 aa  858    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.595986  normal  0.028237 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  58.95 
 
 		 807 aa  918    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3134  ATP-dependent protease La  60.68 
 
 		 788 aa  962    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1171  Lon-A peptidase  56.15 
 
 		 804 aa  877    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.618926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  56.96 
 
 		 808 aa  912    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1644  ATP-dependent protease La  45.24 
 
 		 776 aa  680    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265783  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1382  ATP-dependent protease La  44.78 
 
 		 776 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0489  Lon-A peptidase  59.29 
 
 		 803 aa  930    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2493  Lon-A peptidase  61.37 
 
 		 785 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000173516  normal  0.0963956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2561  Lon-A peptidase  61.37 
 
 		 785 aa  965    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000338529  normal  0.0789552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2286  Lon-A peptidase  59.42 
 
 		 816 aa  949    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.620388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2594  ATP-dependent protease La  61.37 
 
 		 783 aa  962    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000142236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  50.77 
 
 		 812 aa  797    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  56.45 
 
 		 802 aa  868    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  58.95 
 
 		 807 aa  917    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41220  Lon protease  59.64 
 
 		 798 aa  961    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.238701 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  58.95 
 
 		 807 aa  918    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0098  ATP-dependent protease La  52.3 
 
 		 815 aa  815    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000146786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  43.4 
 
 		 790 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3640  Lon-A peptidase  55.6 
 
 		 812 aa  880    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0005782  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2659  Lon-A peptidase  61.1 
 
 		 785 aa  963    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000097236  normal  0.812724 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  48.72 
 
 		 823 aa  758    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  45.5 
 
 		 856 aa  690    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  55.96 
 
 		 805 aa  880    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1226  endopeptidase La  61.24 
 
 		 785 aa  963    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000223975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  61.46 
 
 		 785 aa  974    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>