89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0772 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0772  HAD family hydrolase YedP  100 
 
 
269 aa  555  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2568  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  35.77 
 
 
266 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0146669  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2575  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  35.77 
 
 
266 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00380235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2582  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  35.77 
 
 
266 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00833536  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0736  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.26 
 
 
272 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1773  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.69 
 
 
273 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2501  HAD family hydrolase YedP  36.33 
 
 
267 aa  156  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02159  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.44 
 
 
269 aa  155  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.510436  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2341  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.57 
 
 
276 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.696537  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1889  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  34.73 
 
 
271 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.105757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0501  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.85 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2053  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  35.5 
 
 
274 aa  152  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.483164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2604  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.29 
 
 
312 aa  152  8e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0508  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  36.19 
 
 
287 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3208  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.66 
 
 
277 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2162  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.34 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.556991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2602  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.08 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.370831  normal  0.0340144 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0421  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.31 
 
 
259 aa  139  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00171889  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2848  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  32.22 
 
 
286 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2128  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family  33.85 
 
 
273 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2545  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.44 
 
 
275 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00100234  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1820  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  34.87 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00552439  normal  0.470118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2733  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.65 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000138935  normal  0.573407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1078  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000130246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2188  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258939  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1688  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570883  decreased coverage  0.000939338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2149  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0107149  normal  0.0107752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1229  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000280677  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1694  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase family protein  30.65 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000333785  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1133  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183774  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2145  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00208109  normal  0.0800386 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2203  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.23 
 
 
271 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0526685  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1144  HAD-superfamily hydrolase  30.43 
 
 
694 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.191056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1174  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  30.43 
 
 
694 aa  122  8e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0053101  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1363  bifunctional mannosyl-3-phosphoglycerate synthase/mannosyl-3 phosphoglycerate phosphatase  30.8 
 
 
694 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0011007  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1254  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.43 
 
 
278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0460997  normal  0.891448 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06761  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.55 
 
 
264 aa  112  7.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.41911 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09151  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  31.34 
 
 
266 aa  108  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568947 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0247  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.3 
 
 
269 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.344605  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10431  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  28.63 
 
 
266 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.265902  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08981  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  30.19 
 
 
265 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.67778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08961  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  29.43 
 
 
265 aa  99  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.192004  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2605  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.63 
 
 
263 aa  92  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2242  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.34 
 
 
263 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0839  mannosyl-3-phosphoglycerate phosphatase  27.86 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00773079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1851  Cof-like hydrolase  25.52 
 
 
274 aa  53.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0247  HAD superfamily hydrolase  23.67 
 
 
270 aa  52.4  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00065793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  25.65 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1119  SPP-like hydrolase  26.14 
 
 
227 aa  49.7  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.660919  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  21.8 
 
 
279 aa  48.1  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2352  Cof-like hydrolase  23.88 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  24.19 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  24.91 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.62 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  24.19 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2446  HAD superfamily hydrolase  23.9 
 
 
269 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0783  HAD superfamily hydrolase  21.54 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  26.15 
 
 
271 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1097  HAD superfamily hydrolase  24.91 
 
 
273 aa  45.8  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000207763  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  22.82 
 
 
279 aa  45.8  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5151  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  22.3 
 
 
321 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0638  hypothetical protein  35.62 
 
 
226 aa  45.4  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  24.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  24.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  25.53 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  24.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  25.53 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  24.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  24.91 
 
 
269 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  25.53 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  25.53 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  25.53 
 
 
271 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  22.15 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  23.25 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0780  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  24.21 
 
 
273 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  31.25 
 
 
261 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2034  phosphoglycolate phosphatase  33.73 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.376803  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1945  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.238634 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  23.84 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  23.84 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  23.84 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  25.95 
 
 
270 aa  42.7  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  22.03 
 
 
270 aa  42  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  23.91 
 
 
262 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>