35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0120 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  41.01 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  70.45 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.55 
 
 		 350 aa  65.5  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.43 
 
 		 178 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  23.66 
 
 		 192 aa  52.4  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.84 
 
 		 388 aa  52.4  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  28.06 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  28.06 
 
 		 190 aa  52  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  24.64 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2566  hypothetical protein  52.5 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 191 aa  49.3  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  27.44 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  28.19 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  29.22 
 
 		 180 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  27.27 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  27.61 
 
 		 183 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  26.53 
 
 		 346 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  24.62 
 
 		 273 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.01 
 
 		 175 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  28.99 
 
 		 286 aa  45.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  28.68 
 
 		 196 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  24.81 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.28 
 
 		 175 aa  44.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.16 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  26.53 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.28 
 
 		 175 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  26.19 
 
 		 171 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  26.55 
 
 		 249 aa  42.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  25.1 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.5 
 
 		 175 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>