20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1377 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1268  hypothetical protein  39.81 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3284  hypothetical protein  42.13 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2882  hypothetical protein  42.13 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1187  hypothetical protein  32.59 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1029  hypothetical protein  30.1 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0846  hmc operon protein 5  34.26 
 
 		 226 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0125673  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0873  hmc operon protein 5  33.17 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.727735  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2713  hypothetical protein  29.9 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.992779  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0303  hypothetical protein  35.66 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2409  hmc operon protein 5  31.78 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.07426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2556  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2594  hmc operon protein 5  30.69 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3708  hypothetical protein  26.24 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0649  hmc operon protein 5  35.77 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2254  hmc operon protein 5  31.39 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0572  hmc operon protein 5  27.36 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0565  hypothetical protein  23.7 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533648  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0460  hypothetical protein  28.48 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0165019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  41.67 
 
 		 271 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>