105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3199 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
271 aa  541  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  50.58 
 
 
289 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  49.8 
 
 
254 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  49.02 
 
 
255 aa  214  9e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  32.64 
 
 
262 aa  102  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  35.84 
 
 
249 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  29.28 
 
 
332 aa  89.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  35.87 
 
 
244 aa  88.6  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.63 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  38.12 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  31.84 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  28.52 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  30.61 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  26.67 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  25.94 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  25.86 
 
 
330 aa  79  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  26.52 
 
 
331 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  28.35 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  27.2 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  25.27 
 
 
331 aa  76.3  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  25.77 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  26.75 
 
 
220 aa  72  0.000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  27.69 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  27.6 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  27.2 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  25.29 
 
 
331 aa  68.9  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  32.33 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  26.14 
 
 
342 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  24.17 
 
 
261 aa  63.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.72 
 
 
229 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  26.24 
 
 
334 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  27.14 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.41 
 
 
229 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  29.41 
 
 
229 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30 
 
 
229 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  23.95 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.41 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  39.8 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  28.82 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.82 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.82 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.82 
 
 
229 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.79 
 
 
235 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0778  nitrate reductase gamma subunit  23.33 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.379399  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.33 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.74 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  27.04 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4475  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.75 
 
 
241 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.323862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.3 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.07 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.04 
 
 
225 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3445  nitrate reductase, gamma subunit  24.07 
 
 
225 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.409428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.47 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.48 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.45 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.6 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.71 
 
 
239 aa  47  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.75 
 
 
225 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.25 
 
 
255 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  21.9 
 
 
302 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  21.53 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.62 
 
 
254 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0206  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.32 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1349  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.88 
 
 
242 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2517  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.66 
 
 
227 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189452  normal  0.673257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.67 
 
 
231 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
225 aa  45.4  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  23.81 
 
 
226 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.48 
 
 
225 aa  45.8  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.98 
 
 
241 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  23.35 
 
 
302 aa  45.4  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  23.21 
 
 
226 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3758  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.53 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.47 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5386  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.9 
 
 
227 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.338397  normal  0.0191932 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1762  respiratory nitrate reductase 2 gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4426  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.34 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.325203  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.92 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.81 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  23.21 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  23.21 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0119  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.6 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.88 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.08 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1627  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.6 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.474726  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1542  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.6 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.58 
 
 
227 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1377  hypothetical protein  41.67 
 
 
219 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164003  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5708  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.89 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  26.37 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6461  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.89 
 
 
227 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.153995  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>