23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0605 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0605  hypothetical protein  100 
 
 		 62 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.223312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3381  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1585  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.60479  unclonable  0.000000160377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2976  hypothetical protein  59.09 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.707976 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2196  hypothetical protein  49.02 
 
 		 62 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1224  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000343082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1099  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2298  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.126182  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1068  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0443  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270929  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1179  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.473482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1881  hypothetical protein  49.18 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.418167  normal  0.891396 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1160  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.595805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1987  hypothetical protein  51.11 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.186751  normal  0.0674172 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2599  hypothetical protein  43.1 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.483175  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1092  hypothetical protein  40.38 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2859  hypothetical protein  54.55 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2009  Protein of unknown function DUF2065  36.84 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0115757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5669  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.319752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65260  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07580  hypothetical protein  46.51 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2628  hypothetical protein  51.43 
 
 		 65 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.92924  unclonable  0.00000000000355687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2663  hypothetical protein  40.38 
 
 		 61 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>