More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0648 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
559 aa  1141    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
554 aa  565  1e-160  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  51.16 
 
 
554 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  50.8 
 
 
554 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  52.35 
 
 
559 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 
561 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 
559 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  46.4 
 
 
570 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
561 aa  526  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
551 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  45.99 
 
 
556 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 
563 aa  525  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 
562 aa  519  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
556 aa  518  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 
556 aa  521  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
551 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
557 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
556 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 
564 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
589 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
556 aa  513  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 
564 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
556 aa  514  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
589 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
592 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 
564 aa  510  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
551 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 
556 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 
586 aa  508  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  48.19 
 
 
560 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
587 aa  498  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
550 aa  498  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
584 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
586 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 
556 aa  491  1e-137  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
556 aa  489  1e-137  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
579 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
579 aa  491  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
598 aa  491  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
556 aa  488  1e-136  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
561 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
553 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
553 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
586 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
587 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 
592 aa  479  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
587 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
553 aa  478  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 
551 aa  478  1e-133  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  45.04 
 
 
568 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  46.03 
 
 
550 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
575 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
575 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
553 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
588 aa  462  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 
583 aa  463  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  45.52 
 
 
546 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
546 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
611 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 
559 aa  460  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 
554 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
585 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0632  arginyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
564 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
561 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
609 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
560 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
614 aa  446  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
522 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  41 
 
 
609 aa  445  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 
561 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
609 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
556 aa  442  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
553 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1137  arginyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
564 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0701665  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
547 aa  439  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
598 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
570 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
598 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2750  arginyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
597 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.292272  normal  0.122337 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 
556 aa  433  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
550 aa  431  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1434  arginyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
569 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0988806  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3194  arginyl-tRNA synthetase  43.77 
 
 
592 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
558 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
566 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1758  arginyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
597 aa  428  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
554 aa  427  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
550 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2795  arginyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
597 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0417013  normal  0.0873054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
605 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
575 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.281403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>