40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3844 on replicon NC_008042
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  880    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 		 482 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 469 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  26.08 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  24.6 
 
 		 1241 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  25.72 
 
 		 1089 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 1915 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 		 1243 aa  83.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 1028 aa  80.1  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  22.72 
 
 		 1241 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 1398 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  23.17 
 
 		 1261 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  24.46 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.46 
 
 		 598 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0290  glycosyl transferase, group 1  25.94 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  23.36 
 
 		 787 aa  53.9  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  21.25 
 
 		 743 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  19.9 
 
 		 1229 aa  50.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 609 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 1332 aa  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 369 aa  46.6  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 		 387 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3987  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 519 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 458 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3017  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0284  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 		 780 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  28.23 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 380 aa  43.9  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 359 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0216  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 352 aa  43.9  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 		 467 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>