39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0290 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0290  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
423 aa  857    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  28.86 
 
 
598 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  27.19 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  23.76 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  25.83 
 
 
1028 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  26.41 
 
 
1261 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
437 aa  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7393  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 
1243 aa  47  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 
1229 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1744  glycosyl transferase group 1  33.13 
 
 
348 aa  46.6  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
439 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2510  glycosyl transferase, group 1  37.4 
 
 
345 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568348  normal  0.819187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6180  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  30.49 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.27 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5912  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  27.55 
 
 
387 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  19.25 
 
 
743 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1676  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
639 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
361 aa  43.9  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  31.68 
 
 
403 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  22.56 
 
 
1398 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
358 aa  43.5  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 
377 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2752  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
346 aa  43.1  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>