More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2859 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  58.97 
 
 		 197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  57.67 
 
 		 197 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  57.14 
 
 		 197 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  51.27 
 
 		 198 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  53.93 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  53.61 
 
 		 217 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  47.76 
 
 		 200 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  53.09 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  49.2 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  48.94 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  49.2 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  49.74 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  52.53 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  47.37 
 
 		 199 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  48.92 
 
 		 194 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  54.69 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  46.27 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  52.08 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  52.57 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  50.58 
 
 		 199 aa  154  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  46.6 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  53.68 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  45.18 
 
 		 222 aa  147  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  46.52 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  54.21 
 
 		 212 aa  144  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  45.08 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  49.42 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  44.56 
 
 		 201 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  44.77 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  43.15 
 
 		 203 aa  138  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  41.62 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  44.57 
 
 		 201 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  41.12 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  41.15 
 
 		 200 aa  134  8e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  46.75 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  42.94 
 
 		 202 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  43.5 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  38.22 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  32.81 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  35.03 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  35.05 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  38.95 
 
 		 202 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  38.64 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  34.16 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  30.53 
 
 		 297 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  36.16 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99.4  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  43.4 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  37.64 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  99  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  37.64 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  37.64 
 
 		 202 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  36.16 
 
 		 203 aa  98.2  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0410  dephospho-CoA kinase  34.1 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  38.07 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  31.98 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  37.29 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  37.93 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  31.68 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  29.15 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2981  dephospho-CoA kinase  39.27 
 
 		 196 aa  95.9  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.261477  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  36.32 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1097  dephospho-CoA kinase  38.98 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000202112  hitchhiker  0.0000290776 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  37.93 
 
 		 211 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  38.24 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4314  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 		 200 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000130257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  32.82 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  37.02 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  37.7 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4479  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0168528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4414  dephospho-CoA kinase  31.79 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  31.96 
 
 		 526 aa  93.2  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000964916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4828  dephospho-CoA kinase  33.51 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000028193  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2905  dephospho-CoA kinase  38.55 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0309  dephospho-CoA kinase  35.03 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  35.11 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3608  dephospho-CoA kinase  33.33 
 
 		 205 aa  92  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4709  dephospho-CoA kinase  32.31 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000925481  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3441  dephospho-CoA kinase  32.63 
 
 		 201 aa  92  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0349243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0670  dephospho-CoA kinase  31.61 
 
 		 201 aa  91.7  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1159  dephospho-CoA kinase  31.94 
 
 		 198 aa  91.3  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00128248  normal  0.117716 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 200 aa  91.3  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.08 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  35.5 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4694  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000280087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  34.01 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  33.68 
 
 		 205 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  29.23 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>