50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1409 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1409  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 153 aa  312  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2654  cyclase/dehydrase  47.83 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2487  Polyketide cyclase/dehydrase  43.17 
 
 		 139 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1738  cyclase/dehydrase  40.15 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.265595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3678  cyclase/dehydrase  27.63 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0898363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1801  cyclase/dehydrase  33.65 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1015  cyclase/dehydrase  29.29 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0343567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0957  cyclase/dehydrase  33 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1754  cyclase/dehydrase  36.14 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1018  cyclase/dehydrase  32.99 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7248  integral membrane protein-like protein  30.19 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2639  cyclase/dehydrase  37.35 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.697167  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3967  cyclase/dehydrase  30.12 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3665  cyclase/dehydrase  35.09 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.961718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2865  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1044  cyclase/dehydrase  28.85 
 
 		 272 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214991  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4854  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3412  cyclase/dehydrase  31.33 
 
 		 337 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2902  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15860  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30.12 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00215892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2916  cyclase/dehydrase  25.93 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2872  hypothetical protein  25.93 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0007  cyclase/dehydrase  24.22 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0825  cyclase/dehydrase  29.55 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.987427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4844  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 328 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.327815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1527  cyclase/dehydrase  29.27 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.626943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1021  cyclase/dehydrase  27.35 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1740  cyclase/dehydrase  32.53 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.294422  decreased coverage  0.000862073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1093  cyclase/dehydrase  22.52 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0042  cyclase/dehydrase  29.35 
 
 		 244 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.64456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3430  cyclase/dehydrase  22.9 
 
 		 239 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3666  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0659  cyclase/dehydrase  23.13 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.913891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0103  cyclase/dehydrase  27.71 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6540  cyclase/dehydrase  35.09 
 
 		 287 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472702  normal  0.0557794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1003  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109283  decreased coverage  0.00240737 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0964  bacterio-opsin linked product  26.21 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3433  cyclase/dehydrase  23.16 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.151513  hitchhiker  0.00285229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  30.08 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0812  cyclase/dehydrase  22.3 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2865  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.95842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2801  cyclase/dehydrase  20.95 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0725635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  26.77 
 
 		 1012 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0834  cyclase/dehydrase  24.62 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.179759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2432  cyclase/dehydrase  27.86 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137683  normal  0.165431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0967  bacterio-opsin linked product  25.87 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355962  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37514  predicted protein  32.14 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.458024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0297  cyclase/dehydrase  29.67 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>