25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0565 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_0565  protein TolA  100 
 
 
337 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.370108  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  27.02 
 
 
341 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0469  TonB family protein  32.56 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2230  TonB family protein  38.04 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1393  hypothetical protein  31.82 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0144  TonB-like  30.7 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1453  hypothetical protein  29.18 
 
 
332 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1530  hypothetical protein  29.18 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019c  TolA  22.57 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.957522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1461  TolA family protein  27.74 
 
 
320 aa  53.9  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00341972  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2940  hypothetical protein  27.07 
 
 
298 aa  52.8  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000421874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  31.43 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  34.76 
 
 
330 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  32.86 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0174  protein TolA  22.88 
 
 
273 aa  50.1  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.877426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  32.54 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  32.54 
 
 
333 aa  50.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  41.46 
 
 
334 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  42.27 
 
 
925 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  27.98 
 
 
725 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  30.63 
 
 
901 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0535  protein TolA  28.75 
 
 
345 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000935471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1430  tolA protein  30.29 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000458161  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1606  TolA family protein  28.27 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000895247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0726  TolA family protein  25.69 
 
 
304 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0649134  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>