More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2215 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2215  galactoside ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 564 aa  1130    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0821  Monosaccharide-transporting ATPase  44.28 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00463034 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.59 
 
 		 334 aa  223  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0945  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.2 
 
 		 337 aa  220  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2241  monosaccharide-transporting ATPase  42.63 
 
 		 360 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  39.89 
 
 		 342 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  40.62 
 
 		 342 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0319  inner-membrane translocator  42.9 
 
 		 362 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2325  inner-membrane translocator  43.91 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1565  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  44.62 
 
 		 336 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2997  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.49 
 
 		 336 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1059  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  43.17 
 
 		 336 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.42608  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 330 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2564  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.9 
 
 		 336 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2465  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.9 
 
 		 336 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3019  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.9 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0195645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2334  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.2 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259922  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2427  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.2 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2378  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.2 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2423  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.2 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2535  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  42.2 
 
 		 336 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.943275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3281  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.86 
 
 		 336 aa  166  8e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.692353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2295  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.86 
 
 		 336 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575488  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2748  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.79 
 
 		 336 aa  166  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.845248  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02077  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1510  Monosaccharide-transporting ATPase  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.904375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0823  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.64113  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02036  hypothetical protein  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433899  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2282  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2443  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1500  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.57 
 
 		 336 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  35.08 
 
 		 342 aa  147  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  35.08 
 
 		 334 aa  147  7.0000000000000006e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  35.08 
 
 		 342 aa  147  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1652  inner-membrane translocator  35.78 
 
 		 340 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718181  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  33.02 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 311 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  33.54 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  33.23 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  33.54 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  33.02 
 
 		 311 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  33.23 
 
 		 311 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 311 aa  144  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  34.8 
 
 		 338 aa  144  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 		 835 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4682  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.83 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.377068  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1030  monosaccharide-transporting ATPase  34.91 
 
 		 341 aa  139  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3449  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 314 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  31.95 
 
 		 323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  35.81 
 
 		 313 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  32.05 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  33.64 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  33.44 
 
 		 322 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1518  monosaccharide-transporting ATPase  30.03 
 
 		 345 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0853941  normal  0.0193721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1062  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 345 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.379015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1542  inner-membrane translocator  30.03 
 
 		 345 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  32.84 
 
 		 322 aa  137  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1712  monosaccharide-transporting ATPase  31.61 
 
 		 345 aa  136  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0294222 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  34.1 
 
 		 342 aa  136  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  32.62 
 
 		 318 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0285  carbohydrate ABC transporter permease  33.99 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0196  carbohydrate ABC transporter permease  33.99 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  32.34 
 
 		 345 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  32.15 
 
 		 350 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1424  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 345 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1464  monosaccharide-transporting ATPase  30.29 
 
 		 345 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.987014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  34.12 
 
 		 348 aa  133  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  33.66 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0210  ribose ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 		 339 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 328 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  32.72 
 
 		 314 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4216  ribose ABC transporter permease protein  31.09 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.064291  normal  0.774246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4166  ribose ABC transporter permease protein  31.09 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4110  ribose ABC transporter permease protein  31.09 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.401971  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4275  ribose ABC transporter permease protein  31.09 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4095  ribose ABC transporter permease protein  31.09 
 
 		 321 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6711  sugar ABC transporter membrane protein  33.53 
 
 		 346 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.629939  normal  0.227307 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  31.5 
 
 		 310 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4029  ribose ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 		 330 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0126  monosaccharide-transporting ATPase  33.44 
 
 		 330 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4097  sugar transport system permease  33.44 
 
 		 330 aa  128  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  30.63 
 
 		 322 aa  128  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  34.27 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  31.48 
 
 		 334 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  32.23 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  34.55 
 
 		 333 aa  127  5e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 324 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  30.5 
 
 		 321 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  31.5 
 
 		 310 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>