More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1650 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1650  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
246 aa  497  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000259344  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
248 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  36.8 
 
 
273 aa  149  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  39.02 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  35.08 
 
 
303 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.19 
 
 
280 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  34.05 
 
 
398 aa  142  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.67 
 
 
288 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
280 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  39.91 
 
 
287 aa  140  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
280 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.62 
 
 
280 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000064479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.1 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000574409  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  37.18 
 
 
283 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  37.18 
 
 
283 aa  139  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.6 
 
 
402 aa  138  7e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.94 
 
 
280 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 
300 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.19 
 
 
300 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  35.78 
 
 
278 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.74 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.76 
 
 
300 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  34.14 
 
 
272 aa  135  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1694  ABC transporter related  34.18 
 
 
497 aa  135  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118958  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.72 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1949  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.47 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238648  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.91 
 
 
280 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000109304  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 
395 aa  135  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  37.33 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1503  ABC transporter related  34.38 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.61 
 
 
440 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.47 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.18 
 
 
281 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  34.84 
 
 
380 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.55 
 
 
281 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  35.11 
 
 
277 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  38.46 
 
 
283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 
266 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0499  ABC transporter related  33.77 
 
 
271 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.594452 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35 
 
 
541 aa  132  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.04 
 
 
285 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.95 
 
 
285 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.84 
 
 
274 aa  131  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  35.5 
 
 
283 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  35.22 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  36.45 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0136  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.91 
 
 
279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.95 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  34.75 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.58 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  32.48 
 
 
281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.65 
 
 
403 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  35.41 
 
 
276 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0726  ABC transporter related  34.8 
 
 
262 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.904446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  35.98 
 
 
456 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  33.19 
 
 
288 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  35.78 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  37.2 
 
 
286 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  35.75 
 
 
277 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.58 
 
 
278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  35.27 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  35.27 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.64 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2823  putative cobalt transport system ATP-binding protein  36.32 
 
 
501 aa  126  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2110  ABC transporter related protein  32.62 
 
 
571 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.147486  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0597  ABC transporter-related protein  31.86 
 
 
509 aa  126  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0679613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  32.72 
 
 
593 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
453 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.93 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.18 
 
 
278 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.41 
 
 
252 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1153  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
277 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00125653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1456  ABC transporter related  33.89 
 
 
553 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.539244 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.86 
 
 
277 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.09 
 
 
276 aa  125  6e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.74 
 
 
277 aa  125  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0225  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.7 
 
 
272 aa  125  7e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  31.9 
 
 
249 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.17 
 
 
403 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  33.06 
 
 
274 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.52 
 
 
255 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.92 
 
 
281 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
283 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.49 
 
 
257 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.64 
 
 
281 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3001  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 
279 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.791551  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.66 
 
 
279 aa  124  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0822  cobalt ABC transporter ATPase  35.51 
 
 
491 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  30.34 
 
 
291 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0824  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 
770 aa  124  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  33.19 
 
 
258 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  34.09 
 
 
278 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  37.44 
 
 
590 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0538  ABC transporter, ATPase subunit  33.79 
 
 
242 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.477382  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  31.25 
 
 
411 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1769  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
630 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0143868  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  31.2 
 
 
568 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>