34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0322 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  100 
 
 		 99 aa  197  6e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  51.52 
 
 		 221 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  47.96 
 
 		 221 aa  101  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.33 
 
 		 115 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  43.62 
 
 		 117 aa  84.7  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  44.57 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  41.49 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.43 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  41.24 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.33 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  36.46 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  34.04 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  40.86 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  35.42 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  31.91 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  30.21 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.25 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.12 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.25 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  30.21 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  29.17 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  34.21 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  29.17 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  30.3 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  26.51 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0100  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  26.26 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  31.68 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2377  hypothetical protein  24.73 
 
 		 374 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  25 
 
 		 115 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>