34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0747 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 122 aa  241  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.32 
 
 		 115 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  57.43 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  54 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  49 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.96 
 
 		 107 aa  94  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  35.92 
 
 		 119 aa  91.3  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  46.24 
 
 		 221 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  43.01 
 
 		 221 aa  86.3  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  40.86 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  38 
 
 		 103 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0100  nitrogen regulatory protein P-II  40.22 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  32.69 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  31.87 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  28.43 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.37 
 
 		 105 aa  57.4  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.85 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  33 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  32.67 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.73 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.85 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  33 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  25.96 
 
 		 116 aa  52  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  33 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  30.91 
 
 		 115 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1787  hypothetical protein  30.3 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2377  hypothetical protein  31.11 
 
 		 374 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  32.97 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  33.02 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  30.34 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0018  hypothetical protein  22.45 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000254635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  27.68 
 
 		 116 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>