34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0344 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 126 aa  242  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  56.31 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.92 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  44.44 
 
 		 119 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  48.48 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.48 
 
 		 107 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  54 
 
 		 122 aa  92.8  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 221 aa  88.2  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 		 221 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  41.49 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  48.28 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  33.33 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.62 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  32.04 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  27.83 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.64 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  33.33 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.62 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.62 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  31.07 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  31.62 
 
 		 116 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  29.29 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  25.64 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  31.87 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  32.38 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  27.35 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2377  hypothetical protein  31.11 
 
 		 374 aa  53.5  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  38.38 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0100  nitrogen regulatory protein P-II  34.04 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1829  hypothetical protein  28.42 
 
 		 108 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.449896  hitchhiker  0.0000377036 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  26.55 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  25.86 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>