34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1144 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  55.91 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  51.52 
 
 		 99 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.09 
 
 		 115 aa  90.1  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  44.33 
 
 		 117 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 126 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  40.21 
 
 		 106 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  25.34 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.02 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  46.24 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 		 103 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.69 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  27.84 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  37.76 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  32.32 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  30 
 
 		 116 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.28 
 
 		 116 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  33.33 
 
 		 122 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  27.27 
 
 		 116 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.29 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  29 
 
 		 116 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.28 
 
 		 116 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  30.93 
 
 		 116 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  26.8 
 
 		 115 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  30.95 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  24.24 
 
 		 116 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  25.25 
 
 		 116 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1829  hypothetical protein  24.21 
 
 		 108 aa  45.4  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.449896  hitchhiker  0.0000377036 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  23.81 
 
 		 115 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  23.81 
 
 		 115 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  32.26 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  32.26 
 
 		 112 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  32.26 
 
 		 112 aa  41.6  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>