25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0909 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  26.79 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  25.34 
 
 
221 aa  79  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  36.73 
 
 
106 aa  73.6  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  33.98 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
126 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  31.91 
 
 
99 aa  58.9  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.47 
 
 
115 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  29.29 
 
 
119 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  27.55 
 
 
116 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  27.84 
 
 
107 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.29 
 
 
105 aa  48.9  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  25.26 
 
 
115 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  33.7 
 
 
108 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  25.51 
 
 
116 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  26.53 
 
 
116 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  26.53 
 
 
116 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  24.21 
 
 
115 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  26.53 
 
 
116 aa  45.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0018  hypothetical protein  31.87 
 
 
104 aa  45.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000254635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  27.55 
 
 
116 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  24.49 
 
 
116 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  25.51 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  25.51 
 
 
116 aa  42.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  32.18 
 
 
103 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>