29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0343 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  100 
 
 
119 aa  235  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
117 aa  99.4  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
126 aa  97.8  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.4 
 
 
115 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  34.65 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  32.08 
 
 
221 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  35.92 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  36.46 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.33 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  27.84 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  32.63 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  29.41 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  27.27 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  31.31 
 
 
116 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 
116 aa  53.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  29.29 
 
 
240 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.25 
 
 
116 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  28.97 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  28.28 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0100  nitrogen regulatory protein P-II  30.43 
 
 
121 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  28.12 
 
 
115 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.63 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  29.29 
 
 
116 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  23.3 
 
 
116 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  32.81 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  27.08 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0018  hypothetical protein  26.47 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000254635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>