26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3477 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  100 
 
 		 116 aa  224  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  59.48 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  56.9 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  57.76 
 
 		 116 aa  136  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  53.45 
 
 		 116 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  53.45 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  56.9 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  55.17 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  51.72 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  127  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  43.81 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  34.31 
 
 		 106 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  29.06 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  30 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  27.35 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  27.27 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.99 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  31.37 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  30.51 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  28.21 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  23.3 
 
 		 119 aa  47  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  28.21 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  29.17 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  25.25 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  31.68 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  26.53 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>