34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0339 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
117 aa  124  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  61.32 
 
 
122 aa  120  7e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 
126 aa  106  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
106 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.98 
 
 
107 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  45.26 
 
 
221 aa  94  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  44.33 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  40.4 
 
 
119 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  44.09 
 
 
221 aa  90.1  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
103 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  39.39 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  37.37 
 
 
116 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  38 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  40 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  37.37 
 
 
116 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 
116 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  35.11 
 
 
115 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  35.35 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0100  nitrogen regulatory protein P-II  39.36 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  34.04 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  30 
 
 
116 aa  57  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  29.47 
 
 
240 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  29.17 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  28.07 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  32.99 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  32.63 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  29.67 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  29.79 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  23.66 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  26.6 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2377  hypothetical protein  25.56 
 
 
374 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>