27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0658 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  249  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  63.96 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  46.08 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  42.16 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1829  hypothetical protein  44.21 
 
 		 108 aa  86.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.449896  hitchhiker  0.0000377036 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  40.43 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  38.1 
 
 		 116 aa  76.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  32.38 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1830  hypothetical protein  34.23 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.705773  hitchhiker  0.0000359774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.63 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  34.34 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  36.46 
 
 		 106 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  33.33 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.26 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  32.32 
 
 		 116 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  33.33 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  28.12 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  31.82 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  29.03 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  30.28 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  34.21 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  30.95 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  32.04 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  29.29 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  32.65 
 
 		 116 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  28.57 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  29.29 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>