31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2760 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2760  putative nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.322157  normal  0.0235109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1828  putative nitrogen regulatory protein P-II  87.93 
 
 		 116 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.133078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1499  putative nitrogen regulatory protein P-II  82.76 
 
 		 116 aa  201  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.689557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2273  putative nitrogen regulatory protein P-II  83.62 
 
 		 116 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000994598  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1593  putative nitrogen regulatory protein P-II  76.72 
 
 		 116 aa  183  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004144  nitrogen regulatory protein P-II  72.41 
 
 		 116 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0166  hypothetical protein  70.69 
 
 		 116 aa  173  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1222  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  72.41 
 
 		 116 aa  173  8e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.174539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1951  hypothetical protein  56.9 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3477  putative nitrogen regulatory protein P-II family protein  56.9 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3140  nitrogen regulatory protein P-II  38.24 
 
 		 106 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3686  nitrogen regulatory protein P-II family proteins-like protein  45.13 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0473  nitrogen regulatory protein P-II  32.73 
 
 		 117 aa  70.1  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.34 
 
 		 115 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180511  normal  0.821107 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1089  hypothetical protein  29.06 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0344  nitrogen regulatory protein P-II  29.91 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0660  hypothetical protein  29.66 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0654135  normal  0.148222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0803  hypothetical protein  29.66 
 
 		 115 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3467  hypothetical protein  30.77 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1465  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.35 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0343  PII family protein  29.91 
 
 		 119 aa  53.5  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0658  hypothetical protein  34.34 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2614  nitrogen regulatory protein P-II  26.26 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.103962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1144  nitrogen regulatory protein P-II  27.27 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000024925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1788  nitrogen regulatory protein P-II  30.61 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000022602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0322  P-II family regulatory protein  30.21 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.10652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0019  P-II family regulatory protein  38.37 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000803285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0909  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  47.8  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1722  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  26.17 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0747  nitrogen regulatory protein P-II  28.85 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00943314  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0801  hypothetical protein  28.57 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>