176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0117 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0117  preprotein translocase subunit YajC  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000495791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  45.07 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  36.78 
 
 
137 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2203  preprotein translocase, YajC subunit  46.97 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.935333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  38.1 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  37.97 
 
 
102 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  37.5 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  38.96 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  34.57 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  40.85 
 
 
101 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.87 
 
 
109 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  41.33 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  36.9 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  44.59 
 
 
90 aa  50.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  40.3 
 
 
116 aa  50.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  38.36 
 
 
103 aa  50.8  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2078  protein translocase subunit yajC  49.15 
 
 
106 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.459618  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  37.66 
 
 
86 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  28.12 
 
 
109 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  38.16 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  35.9 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  34.67 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.96 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  35.06 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  42.03 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  33.77 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1229  preprotein translocase subunit YajC  37.97 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.655202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0275  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000715247  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  34.21 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  45.16 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  32.43 
 
 
90 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  34.21 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  34.52 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
108 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
108 aa  47  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  40.24 
 
 
117 aa  47  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  34.78 
 
 
91 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  29.79 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2434  preprotein translocase subunit YajC  32.93 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  30.61 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  33.77 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  31.17 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1965  preprotein translocase, YajC subunit  47.69 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.462066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2192  preprotein translocase subunit YajC  41.82 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0011264  hitchhiker  0.00792113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  34.29 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0068  preprotein translocase, YajC subunit  34.94 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0068  preprotein translocase, YajC subunit  36.36 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.95541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01047  preprotein translocase subunit YajC  38.33 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  34.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  42.03 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  39.74 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2200  preprotein translocase subunit YajC  36.47 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1911  preprotein translocase subunit YajC  36.47 
 
 
89 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0862101  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  37.8 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  28.57 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  36.59 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  35.21 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0394  preprotein translocase, YajC subunit  29.33 
 
 
126 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.918235  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0271  preprotein translocase subunit YajC  35.21 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.253267  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  32 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01346  preprotein translocase subunit YajC  31.65 
 
 
112 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153767  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004366  preprotein translocase subunit YajC  32.91 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  39.71 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  43.66 
 
 
112 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1241  protein translocase subunit  29.63 
 
 
116 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000875528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  31.62 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1292  preprotein translocase, YajC subunit  33.82 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  5.005270000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1402  preprotein translocase subunit YajC  37.18 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000229037  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  34.29 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  35.29 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  33.8 
 
 
114 aa  43.5  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2483  preprotein translocase subunit YajC  36.36 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000329003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  34.29 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  34.29 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  36.59 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0108  hypothetical protein  34.69 
 
 
118 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>