64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13896 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13896  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  780    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0175743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0069  hypothetical protein  60.32 
 
 
390 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5779  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  52.55 
 
 
532 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374626  normal  0.249782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0061  hypothetical protein  56.69 
 
 
319 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0051  hypothetical protein  56.69 
 
 
319 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00417598 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0070  hypothetical protein  56.69 
 
 
319 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.216114  normal  0.0962693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0776  hypothetical protein  57.51 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.727496  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0073  chromosome partitioning ATPase  36.1 
 
 
619 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3652  chromosome partitioning ATPase  33.99 
 
 
478 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114949  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13923  hypothetical protein  33.57 
 
 
341 aa  156  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.979459  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3653  chromosome partitioning ATPase  32.88 
 
 
418 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0511335  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5275  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  34.28 
 
 
698 aa  152  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0128  chromosome partitioning ATPase  32.19 
 
 
665 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  30.64 
 
 
495 aa  145  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5968  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.33 
 
 
552 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0077  chromosome partitioning-like ATPase  32.32 
 
 
639 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.989213  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0080  hypothetical protein  32.82 
 
 
455 aa  143  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123859  normal  0.0231651 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5565  hypothetical protein  30.54 
 
 
414 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.114758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0147  chromosome partitioning ATPase  31.27 
 
 
899 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4411  chromosome partitioning ATPase protein-like  35.66 
 
 
759 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43102  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0163  hypothetical protein  31.74 
 
 
771 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0696  hypothetical protein  30.16 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0689  hypothetical protein  30.16 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.211622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0709  hypothetical protein  30.16 
 
 
388 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0618314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9252  chromosome partitioning ATPase  32.53 
 
 
330 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02980  chromosome partitioning ATPase  29.48 
 
 
343 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0765  hypothetical protein  31.76 
 
 
463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10541  hypothetical protein  30.25 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.06811e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2288  hypothetical protein  31.97 
 
 
346 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0870  hypothetical protein  29.24 
 
 
362 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.20126  normal  0.386296 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5456  hypothetical protein  30.22 
 
 
425 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13911  proline and alanine rich protein  31.6 
 
 
666 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000165263  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0072  hypothetical protein  31.14 
 
 
475 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12800  hypothetical protein  30.2 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0081  hypothetical protein  31.14 
 
 
475 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0649479  hitchhiker  0.00792141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0048  hypothetical protein  29.69 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.352611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0062  hypothetical protein  31.14 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0623  chromosome partitioning ATPase  32.71 
 
 
544 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8473  chromosome partitioning ATPase  32.43 
 
 
968 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4873  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  29.8 
 
 
412 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3058  chromosome partitioning-like ATPase  30.27 
 
 
926 aa  103  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2936  hypothetical protein  26.1 
 
 
416 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3172  hypothetical protein  26.83 
 
 
453 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.209106  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0476  chromosome partitioning ATPase  29.29 
 
 
1160 aa  90.9  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0587  ATPase involved in chromosome partitioning  27.15 
 
 
534 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.068267  normal  0.016158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0137  hypothetical protein  27.8 
 
 
1519 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1098  chromosome partitioning ATPase  27.27 
 
 
1132 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0331  hypothetical protein  24.86 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03240  chromosome partitioning ATPase  25.08 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.334592  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4616  chromosome partitioning ATPase  27.43 
 
 
811 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5977  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  25 
 
 
542 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3425  hypothetical protein  26.04 
 
 
474 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.945444  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3199  hypothetical protein  27.54 
 
 
487 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2421  putative signal peptide  25.67 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0137  chromosome partitioning ATPase  22.82 
 
 
586 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.458231  decreased coverage  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.04 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16660  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
288 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0132  chromosome partitioning ATPase  22.78 
 
 
533 aa  46.2  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422439  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4553  hypothetical protein  25.48 
 
 
497 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.387687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  24.65 
 
 
390 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  29.52 
 
 
2272 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0797  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 
260 aa  43.5  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.123163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1763  septum site-determining protein MinD  26.13 
 
 
271 aa  43.5  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000014274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  25.73 
 
 
274 aa  43.1  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>