281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13709 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  293  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  75.71 
 
 
162 aa  214  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  75.71 
 
 
162 aa  214  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  75.71 
 
 
162 aa  214  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  71.71 
 
 
153 aa  201  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  67.11 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1369  endoribonuclease L-PSP  69.39 
 
 
153 aa  190  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.324136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  65.54 
 
 
154 aa  190  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5437  endoribonuclease L-PSP  74.26 
 
 
152 aa  188  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.491285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  71.33 
 
 
152 aa  187  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  67.55 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 
177 aa  181  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3039  Endoribonuclease L-PSP  64.9 
 
 
157 aa  179  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  62.25 
 
 
153 aa  178  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  56.95 
 
 
152 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4789  endoribonuclease L-PSP  63.5 
 
 
153 aa  175  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0118265 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4348  endoribonuclease L-PSP  62.77 
 
 
153 aa  174  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.917733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36190  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  68 
 
 
151 aa  174  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  68.49 
 
 
152 aa  174  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3934  Endoribonuclease L-PSP  61.07 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0515  Endoribonuclease L-PSP  67.79 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0499  Endoribonuclease L-PSP  65.58 
 
 
162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.389355  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  65.07 
 
 
155 aa  167  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5312  Endoribonuclease L-PSP  64.86 
 
 
153 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.688432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  65.07 
 
 
163 aa  165  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  62.67 
 
 
154 aa  164  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  59.46 
 
 
154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  48 
 
 
156 aa  159  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1252  endoribonuclease L-PSP  59.46 
 
 
156 aa  159  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.476616  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18300  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  63.95 
 
 
166 aa  157  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.614303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  56.85 
 
 
151 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1661  Endoribonuclease L-PSP  54.36 
 
 
162 aa  158  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0114  hypothetical protein  61.7 
 
 
155 aa  157  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  56.85 
 
 
154 aa  156  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1999  endoribonuclease L-PSP  66.43 
 
 
161 aa  155  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  56.85 
 
 
154 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  63.7 
 
 
154 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  55.1 
 
 
154 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3397  endoribonuclease L-PSP  63.46 
 
 
189 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  52.7 
 
 
156 aa  153  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 
153 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25430  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  56.95 
 
 
157 aa  149  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  49.32 
 
 
156 aa  148  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1530  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 
160 aa  147  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  54.55 
 
 
157 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  51.7 
 
 
156 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26250  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  62.84 
 
 
167 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04880  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  61.11 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 
156 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 
155 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1123  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 
155 aa  144  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.321047  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  53.9 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  52.98 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
155 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  47.65 
 
 
151 aa  142  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0426  Endoribonuclease L-PSP  60.69 
 
 
158 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.235874 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  54.42 
 
 
155 aa  141  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 
162 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  53.06 
 
 
155 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  52.6 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  54.23 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  51.7 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  52.03 
 
 
155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  51.37 
 
 
152 aa  137  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0137  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 
155 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  51.37 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  50.34 
 
 
155 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1470  endoribonuclease L-PSP  49.01 
 
 
157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2518  Endoribonuclease L-PSP  57.64 
 
 
151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0151498  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  50.33 
 
 
155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
155 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2555  hypothetical protein  50.33 
 
 
154 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  49.66 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  48.63 
 
 
158 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7458  Endoribonuclease L-PSP  53.21 
 
 
157 aa  133  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1792  endoribonuclease L-PSP  47.02 
 
 
156 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.282183  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  50.68 
 
 
154 aa  131  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3580  endoribonuclease L-PSP  47.68 
 
 
153 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  0.209775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1498  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
160 aa  131  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  44 
 
 
154 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 
155 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 
152 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  45.21 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1272  endoribonuclease L-PSP  49.67 
 
 
153 aa  130  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.103554  hitchhiker  0.00713107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  48.03 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>