More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10785 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10785  dehydrogenase/reductase  100 
 
 
295 aa  586  1e-166  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5155  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  65.38 
 
 
290 aa  368  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1602  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  67.63 
 
 
284 aa  355  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4959  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  64.77 
 
 
286 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  64.41 
 
 
286 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4664  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  64.41 
 
 
286 aa  354  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147523  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3849  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.43 
 
 
291 aa  309  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3694  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  33.19 
 
 
272 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.450315  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3767  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.19 
 
 
272 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4173  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.06 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392331  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3707  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.31 
 
 
272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.608157  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  40.31 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.04 
 
 
296 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
296 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.04 
 
 
296 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.04 
 
 
296 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2481  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.31 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.29 
 
 
298 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  33.93 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  33.93 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  33.93 
 
 
294 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  33.93 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  33.93 
 
 
294 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  32.73 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  32.73 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  32.73 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  32.73 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  32.73 
 
 
296 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.56 
 
 
294 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7151  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.89 
 
 
269 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.711255  decreased coverage  0.00716057 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.59 
 
 
284 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4279  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.08 
 
 
264 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.803902 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.27 
 
 
300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.97 
 
 
286 aa  119  6e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.34 
 
 
284 aa  118  9e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.22 
 
 
303 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.28 
 
 
309 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.22 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.93 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.92 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  34.8 
 
 
294 aa  113  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.82 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34 
 
 
292 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.75 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.57 
 
 
298 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.91 
 
 
289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1513  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.68 
 
 
321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.96 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2415  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.96 
 
 
315 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.942555  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.99 
 
 
321 aa  108  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0231  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.01 
 
 
287 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3283  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.02 
 
 
278 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3424  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.76 
 
 
296 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0751599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5060  oxidoreductase, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor  31.94 
 
 
301 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2145  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.14 
 
 
293 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.52 
 
 
283 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  31.56 
 
 
296 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27951  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.84 
 
 
301 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  34.63 
 
 
296 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  32.97 
 
 
294 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.13 
 
 
297 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.13 
 
 
297 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4459  NADP oxidoreductase  34.33 
 
 
291 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00439637  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30 
 
 
292 aa  105  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.59 
 
 
284 aa  106  6e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.43 
 
 
301 aa  105  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6400  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.62 
 
 
297 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2461  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.7 
 
 
295 aa  105  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.6727 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  32.31 
 
 
305 aa  105  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.23 
 
 
298 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  34.07 
 
 
294 aa  105  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.7 
 
 
289 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36 
 
 
302 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1634  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
299 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00409497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.63 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08981  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenases  30 
 
 
287 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.271711  hitchhiker  0.000281132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54670  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
298 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.83696  hitchhiker  0.000010736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1304  6-phosphogluconate dehydrogenase  30 
 
 
298 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.08 
 
 
294 aa  103  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.75 
 
 
295 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5146  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.86 
 
 
307 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.74741  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0284  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.37 
 
 
292 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37 
 
 
286 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2850  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  30.6 
 
 
298 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.422789  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.09 
 
 
298 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.33 
 
 
293 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  31.73 
 
 
288 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05191  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.63 
 
 
292 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.71 
 
 
293 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
295 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7141  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.65 
 
 
303 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.07 
 
 
288 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02335  oxidoreductase, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor (AFU_orthologue; AFUA_5G10280)  32.57 
 
 
434 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.266976  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
295 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.62 
 
 
296 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2547  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.44 
 
 
294 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672659  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.51 
 
 
304 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
295 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.51 
 
 
301 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.8 
 
 
304 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>