More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1775 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1775  thioredoxin  100 
 
 		 92 aa  191  3e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0589  thioredoxin  82.61 
 
 		 111 aa  166  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  68.48 
 
 		 107 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  58.7 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  58.7 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  58.7 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  53.26 
 
 		 108 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03659  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000771604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4196  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000515955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03608  hypothetical protein  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000236523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4142  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4245  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.775484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4304  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.234233  normal  0.940905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4127  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4145  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3997  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4222  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00219843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4196  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4140  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5214  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4292  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2698  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0171911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0806  thioredoxin  54.35 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0657  thioredoxin  54.35 
 
 		 108 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0175  thioredoxin  54.35 
 
 		 108 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5457  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5129  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025918  normal  0.808925 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1739  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.146348  normal  0.112507 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0159  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.447164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6251  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.040042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1852  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0771172  normal  0.135016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1445  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0251303  normal  0.275114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1766  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.37558  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1828  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0156587  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0044  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0410527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2208  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1364  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283304  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2246  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1853  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0570457  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4012  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1125  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2218  thioredoxin  51.09 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.312249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2374  thioredoxin 1  51.09 
 
 		 146 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2468  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4204  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0147  thioredoxin 1  51.09 
 
 		 108 aa  106  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000169587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69200  thioredoxin  53.26 
 
 		 108 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5243  thioredoxin  51.09 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002097  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00313258  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2117  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0127  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000655412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0950  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.263431  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2056  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0357  thioredoxin  48.91 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00337  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1825  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0606148  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0057  thioredoxin  52.17 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2362  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0224789  normal  0.140308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0156  thioredoxin  46.74 
 
 		 108 aa  105  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5215  thioredoxin  52.17 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1188  thioredoxin 1 (redox factor) protein  47.83 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.945237  normal  0.545287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  53.26 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5124  thioredoxin  52.17 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2084  thioredoxin  46.74 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0460  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.810082  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0203  thioredoxin  48.91 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3190  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425401  hitchhiker  0.00537167 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1032  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0280338  normal  0.216175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1124  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0722597  normal  0.17575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5983  thioredoxin  52.17 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1307  thioredoxin  46.74 
 
 		 108 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  50 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4905  thioredoxin  48.91 
 
 		 110 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5038  thioredoxin  51.09 
 
 		 109 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0406  thioredoxin 1  50 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5276  thioredoxin  51.09 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0300  thioredoxin  50.55 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47420  Thioredoxin 1, trx1  48.91 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2583  thioredoxin  46.74 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00569  thioredoxin  48.91 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.181003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4222  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0161465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0308  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0410  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3615  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0368  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27502 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0409  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  102  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00884025 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0475  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0639  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3433  thioredoxin  48.91 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2289  thioredoxin  45.65 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876713  normal  0.363166 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  50 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3216  thioredoxin  50 
 
 		 108 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.604019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3929  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  47.83 
 
 		 107 aa  100  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3877  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000866569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3952  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4070  thioredoxin  47.83 
 
 		 108 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0448  thioredoxin  48.91 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>