24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1644 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1644  phage integrase family protein  100 
 
 		 384 aa  783    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0715  phage integrase family protein  72.92 
 
 		 384 aa  545  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07651  Phage integrase family  67.36 
 
 		 387 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.131913 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05271  phage integrase family protein  57.59 
 
 		 389 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1856  XisA-like site specific recombinase  53.26 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05811  phage integrase family protein  52.48 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05801  phage integrase family protein  50.91 
 
 		 389 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0844338  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05501  phage integrase family protein  49.87 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0524  phage integrase family protein  49.61 
 
 		 389 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05881  phage integrase family protein  49.09 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.152318  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0136  phage integrase  52.32 
 
 		 435 aa  359  4e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4516  integrase family protein  49.35 
 
 		 388 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000228037  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0049  Phage integrase  33.25 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3928  Phage integrase  25.91 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.281381  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0716  hypothetical protein  30.1 
 
 		 366 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4884  site-specific recombinase (xisC)-like  24.29 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0319246  hitchhiker  0.00583369 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1443  phage integrase family protein  26.52 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0279808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_12771  hypothetical protein  23.53 
 
 		 386 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0568502 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1720  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 390 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0253216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1706  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 390 aa  50.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00461976 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3265  phage integrase family protein  33.85 
 
 		 313 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2243  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.688916  normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0565  hypothetical protein  26.4 
 
 		 414 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.44782  normal  0.562637 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0623  Bbp50  30.3 
 
 		 356 aa  43.1  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.951969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>