24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0973 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0973  carotenoid binding protein  100 
 
 		 318 aa  647    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4467  Orange carotenoid protein  63.61 
 
 		 319 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3843  steroid delta-isomerase  63.38 
 
 		 319 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5565  Orange carotenoid protein  52.38 
 
 		 319 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2542  orange carotenoid protein  50.78 
 
 		 325 aa  322  5e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.381237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2230  hypothetical protein  48.8 
 
 		 171 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0711695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3555  Orange carotenoid protein  48 
 
 		 165 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2551  Orange carotenoid protein  48 
 
 		 165 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2834  orange carotenoid protein  45.24 
 
 		 173 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1628  Orange carotenoid protein  45.64 
 
 		 165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3554  nuclear transport factor 2  43.31 
 
 		 132 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.71115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2552  nuclear transport factor 2  43.31 
 
 		 132 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4810  Orange carotenoid protein  39.35 
 
 		 166 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.567662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2720  water-soluble carotenoid protein  40.62 
 
 		 137 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1930  Orange carotenoid protein  36.18 
 
 		 160 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4694  hypothetical protein  36.42 
 
 		 163 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2835  nuclear transport factor 2  39.53 
 
 		 138 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2231  steroid delta-isomerase  40.48 
 
 		 157 aa  95.9  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.236176  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4768  orange carotenoid protein  35.76 
 
 		 163 aa  91.3  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1627  steroid delta-isomerase  38.1 
 
 		 139 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.280096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0443  Orange carotenoid protein  26.25 
 
 		 149 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490536  normal  0.313784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1426  Orange carotenoid protein  25.74 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1448  nuclear transport factor 2  28.72 
 
 		 134 aa  42.7  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  28.33 
 
 		 138 aa  42.4  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>